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IPA 生物信息学分析介绍 - 上海易算生物科技有限公司
上海易算生物科技有限公司
IPA 生物信息学分析介绍
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目录
1. 为何要使用 IPA 分析替代常规分析 3
1.1 功能全面准确 3
1.2 分析流程 3
1.3 数据库 3
1.4 接受程度高 4
1.5 IPA 分析报告内容说明 5
2. 查询服务举例 5
2.1 基本介绍 5
2.2 举例:三阴乳腺癌相关分子信息 5
2.2.1 三阴乳腺癌相关分子信息(BIOPROFILER 报告) 5
2.2.2 对应信息的网络图 6
3. 数据分析举例 7
3.1 基本介绍 7
3.2 所需数据格式 8
3.3 IPA 打分算法简介 8
3.3.1 P-VALUE 8
3.3.2 Z-SCORE 8
3.4 分析结果列举 8
4. IPA 主要分析模块间的关系 9
4.1 功能、疾病相关性/生物学效应 FUNCTION 10
4.1.1 说明 10
4.1.2 结果内容 10
4.1.3 结果表格(举例) 11
4.1.4 柱状总结图 12
4.1.5 效应聚类热图 12
4.1.6 功能互作网络(举例) 13
4.1.7 相应网络文献判别证据及其文献总结 13
4.2 经典通路分析/通路活性效应 PATHWAY 14
4.2.1 说明 14
4.2.2 结果内容 14
4.2.3 结果表格(部分内容) 15
4.2.4 柱状总结图 15
4.2.5 详细调控通路图 16
4.3 转录调控分析 UPSTREAM 21
4.3.1 说明 21
4.3.2 结果内容 21
4.3.3 结果表格(举例) 22
4.3.4 转录调控网络图 23
4.3.5 相应网络文献判别证据及其文献总结 23
4.4 相互作用网络 NETWORK 24
4.4.1 说明 24
1
4.4.2 结果内容 24
4.4.3 结果表格(举例) 25
4.4.4 互作网络图 25
4.5 毒理学 TOX LIST/FUNCTION 26
4.6 调控子效应网络 REGULATOR EFFECTS 26
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