基于多核学习的医学文献蛋白质关系抽取医学文献蛋白质 - 计算机工程.pdfVIP

第37 卷 第 10 期 计 算 机 工 程 2011 年 5 月 Computer Engineering May 2011 Vol.37 No.10 文献标识码文献标识码：：A 文献标识码文献标识码：： 中图分类号中图分类号：：TP311.12 文章编号文章编号：：1000——3428(2011)10——0184——03 中图分类号中图分类号：： ·人工智能及识别技术·人工智能及识别技术 ·· 文章编号文章编号：： —— —— —— ··人工智能及识别技术人工智能及识别技术 ·· 基于多核学习的基于多核学习的医学文献蛋白质关系抽取医学文献蛋白质关系抽取 基于多核学习的基于多核学习的医学文献蛋白质关系抽取医学文献蛋白质关系抽取 唐唐 楠，楠 ，杨志豪杨志豪 ，林鸿飞，林鸿飞 ，李彦鹏，李彦鹏 唐唐 楠楠 ，，杨志豪杨志豪，，林鸿飞林鸿飞 ，，李彦鹏李彦鹏 (大连理工大学计算机科学与技术学院 ，辽宁 大连 116024) 摘摘 要：要 ：从生物医学文献中抽取蛋白质交互作用关系对蛋白质知识网络的建立、新药的研制等均具有重要的意义。为此 ，提出一种基于多 摘摘 要要 ：： 核学习的方法 ，用于从文献中自动抽取蛋白质关系信息。该方法融合基于特征的核、树核以及图核，并扩展最短路径依存树以及依存路径 以利用更多的上下文关系信息。在 AImed 语料上的实验得到 63.9%的 F 值和 87.83%的 AUC 值，表明该方法具有较好的性能。 关键词关键词：文本挖掘： ；信息抽取；蛋白质关系抽取；核方法；多核学习 关键词关键词：： Protein-protein Interaction Extraction from Medical Literature Based on Multiple Kernels Learning TANG Nan, YANG Zhi-hao, LIN Hong-fei, LI Yan-peng (College of Computer Science and Technology, Dalia University of Technology, Dalian 116024, China) 【【Abstract 】】Automatic extracting protein-protein interaction i formation from biomedical literature can help to build protein relation network and 【【 】】 design new drugs. This paper presents a multiple kernels learning based