史丹福微阵列数据库 (smd) 存有来自微阵列实验的 .docVIP

史丹福微阵列数据库 生命科学院2002级生物技术 孙广雷 021402172 一、摘要 史丹福微阵列数据库(SMD)存有来自微阵列实验的原始的正规化数据，同时它也为研究员提供网络接口来取回数据，分析数据，使数据可视化。 史丹福微阵列数据库眼前有两个目标，一是作为斯坦福大学正在研究中得出的微阵列数据的一个储藏位置，第二就是来推动曾经被出版或被研究人员公开发布的数据的公开传播。更为重要的是它有属于在微阵列上被存放的DNA的生物学的数据和微阵列数据的连接(基因,及其他复制)。 史丹福微阵列数据库(SMD)利用许多公众的资源连接来传达一些相关生物学的信息及资料。 二、介绍 微阵列实验通常被运行实施在基因组衡量尺度上的基因表达或DNA副本数字。典型地数千DNA取样被放在载玻片上,同时在实验取样中的，被标记了的cDNA和基因组DNA，被选择性的进行杂交编排。然后载玻片上的图像被获得并且处理生成一个包含用数十个点来代表成千上万个数据点的数据文件。虽然每个点突出的数据是那些实验的样品和控制样品之间的比，但是其他数值可能被用作滤除的标准来决定哪一些数据是可靠的。因此，对每个点的全面分析需要用到对每个点所有数据的存取。一个20000个点的单一微阵列可能在百万条数据的次序和实验的系列中产生，可能因此产生超过五千万个数据点。史丹福微阵列数据库(SMD)的一个主要的目