分子生物学： 遗传物质的分子结构和性质.ppt

第二章 染色体与DNA 遗传物质的分子结构和性质 基因组和染色体 DNA的复制 DNA损伤与修复 重组和转座 第一节 核酸的分子结构 1869年 J.T.Miescher 发现核素（muclein） 米歇尔在作博士论文时要确定淋巴细胞蛋白质的组成，不想却发现了一种既不溶解于水、醋酸，也不溶解于稀盐酸和食盐溶液的未知的新物质，最终证实这种物质存在于细胞核里，便将它定名为“核质”。后由瑞典著名生化学家阿尔特曼建议将“核质”定名为“核酸”。 1885—1900年间，Kossel、Johnew、Levene证实核酸由不同的碱基组成。其最简单的单体结构是碱基-核糖-磷酸构成的核苷酸。1929年又确定了核酸有两种，一种是脱氧核糖核酸(DNA)，另一种是核糖核酸(RNA)。 这五种碱基的结构如图 核酸分子中还发现数十种修饰碱基（the modified component),又称稀有碱基，(unusual component)。它是指上述五种碱基环上的某一位置被一些化学基团（如甲基化、甲硫基化等）修饰后的衍生物。DNA中的修饰碱基主要见于噬菌体DNA，RNA中以tRNA含修饰碱基最多。 戊糖: RNA中的戊糖是D－核糖， DNA中的戊糖是D－2－脱氧核糖。 D－核糖的Ｃ－2所连的羟基脱去氧就是D－2脱氧核糖。 核苷（nucleoside)：由D－核糖或D－2脱氧核糖与嘌呤或嘧啶通过糖苷键连接组成的化合物。核酸中的主要核苷有八种。 核苷酸(nucleotide)：核苷与磷酸残基构成的化合物，即核苷的磷酸酯。核苷酸是核酸分子的结构单元。核苷酸中戊糖上的所有游离羟基均可与磷酸形成酯键，但生物体内多数核苷酸的磷酸连接在核糖或脱氧核糖的C-5′上，形成5′-核苷酸。 DNA分子中是含有A、G、C、T四种碱基的脱氧核苷酸；RNA分子中则是含A、G、C、U四种碱基的核苷酸。 5’－磷酸腺苷的结构式 含有1个磷酸基团的核苷酸称为核苷一磷酸（NMP），含有2个磷酸基团的核苷酸称为核苷二磷酸（NDP），有3个磷酸基团的核苷酸称为核苷三磷酸（NTP）。如AMP是腺苷一磷酸，GDP是鸟苷二磷酸，CTP是胞苷三磷酸。 DNA的一级结构 四种脱氧核苷酸按一定的排列顺序，以3′, 5′-磷酸二酯键相连接，形成多聚脱氧核苷酸链，即DNA。 DNA的一级结构是指DNA分子中核苷酸的排列顺序及其连接方式。 DNA分子中脱氧核苷酸的连接有严格的方向性，前一个脱氧核苷酸的3′-羟基（-OH）下一个脱氧核苷酸的5′-磷酸形成3′，5′-磷酸二酯键，从而构成一个没有分支的线性大分子，其两个末端分别是5′-末端（游离磷酸基）和3′-末端（游离羟基）。 寡核苷酸（oligonucleotide)：这是与核酸有关的文献中经常出现的一个术语，一般是指二至十个核苷酸残基以磷酸二酯键连接而成的线性多核苷酸片段。 但在使用这一术语时，对核苷酸残基的数目并无严格规定，在不少文献中，把含有三十甚至更多个核苷酸残基的多核苷酸分子也称作寡核苷酸。 寡核苷酸目前已可由仪器自动合成，它可作为DNA合成的引物（primer)、基因探针（probe)等， 核酸链的简写式 字符式： 用英文大写字母缩写符号代表碱基， 用小写英文字母P代表磷酸残基。 核酸分子中的糖基、糖苷键和酯键等均省略不写，将碱基和磷酸相间排列即可。 简写式中出现Ｔ就视为DNA链，出现Ｕ则视为RNA链。 以5＇和3＇表示链的末端及方向，分别置于简写式的左右二端。 5＇pＡpＣpＴpＴpＧpＡpＡpＣpＧ3＇DNA5＇pＡpＣpＵpＵpＧpＡpＡpＣpＧ3＇RNA 此式可进一步简化为： 5＇pＡＣＴＴＧＡＡＣＧ3＇5＇pＡＣＵＵＧＡＡＣＧ3＇ 上述简写式的5′－末端均含有一个磷酸残基（与糖基的Ｃ－5′位上的羟基相连）,3′－末端含有一个自由羟基（与糖基的Ｃ－3′位相连）,若5′端不写Ｐ，则表示5′－末端为自由羟基。 双链DNA分子的简写式多采用省略了磷酸残基的写法，在上述简式的基础上再增加一条互补链（complentary strand)即可，链间的配对碱基用短纵线相连或省略。 5＇ＧＧＡＡＴＣＴＣＡＴ3＇3＇ＣＣＴＴＡＧＡＧＴＡ5＇ ?线条式：在字符书写基础上，以垂线（位于碱基之下）和斜线（位于垂线与Ｐ之间）分别表示糖基和磷酸酯键。 斜线与垂线部的交点为糖基的Ｃ－3＇位，斜线与垂线下端的交点为糖基的Ｃ－5＇位。 DNA的一级结构 DNA的一级结构是指DNA分子中核苷酸的排列顺序，DNA顺序（或序列）是这一概念的简称。由于核苷酸之间的差异仅仅是碱基的不同，故可称为碱基顺序。 DNA分子中不同排列顺序的DNA区段构成特定的功能单位，这就是基因，不同基因的功能各异，各自分布在DNA的一定区域。 DNA的二级结构—