第二讲真核生物基因组介绍.docVIP

第二讲 真核生物基因组 真核生物的基因组比较庞大，例如人的单倍体基因组由36×109 bp组成。在人细胞的整个基因组中只有很少一部份（约占2~3％）的DNA序列用以编码蛋白质。 真核生物体细胞内的基因组是双份的（倍体diploid），即有两份同源的基因组真核细胞基因转录产物为单顺反子一个结构基因经过转录和翻译生成一个mRNA分子和一条多肽链存在重复序列，重复次数可达百万次以上基因组中不编码的区域多于编码区域大部分基因含有内含子，因此，基因是不连续的基因组远远大于原核生物的基因组，具有许多复制起点，每个复制子的长度较小。DNA与蛋白质结合形成染色体chromosome）。除配子细胞外体细胞染色体基因组有两份同源的基因组储存于细胞核内核小体nucleosome）的形成使DNA大约压缩6~7倍，从核小体到形成30nm螺线管纤维solenoidal fiber）又使DNA压缩6倍30nm螺线管纤维缠绕在一个由某些非组蛋白构成的中心轴centralaxis）骨架上形成螺线管纤维环loops）再一次使DNA压缩，最后，从螺线管纤维环到包装形成染色体是DNA压缩程度最高的阶段染色体DNA总共被压缩了8100倍 （二） 线粒体基因组 线粒体基因组DNA（mitochondrial DNA，mtDNA）为双链环状超螺旋分子质粒DNA分子量多在1~200×106之间mtDNA仅由16569 bp组成。mtDNA的复制属于半保留复制可以是θ型复制，或滚环复制D环复制聚合酶完成线粒体蛋白质酶呼吸链中细胞色素氧化酶有七个亚基，其中三个亚基mtDNA编码，四个亚基由细胞核DNA编码酶有七个亚基，基中一个由mtDNA编码ATP酶含有十个亚基，其中四个由mtDNA编码抗药性基因有自己的rRNA，tRNA，核糖体等可以近几年的研究发现哺乳动物mtDNA的遗传密码与通用的遗传密码有以下区别：UGA不是终止密码而是色氨酸的多肽内部的甲硫氨酸由AUG和AUA两个密码子编码而起始甲硫氨酸由AUGAUA、AUU和AUC四个密码子编码AGA、AGG不是精氨酸的密码子，而是终止密码子在线粒体密码系统中4个终止密码子（UAAUAG、AGA、AGG）真核细胞基因为单顺反子monocistron），一个结构基因经过转录生成一个mRNA分子翻译一条多肽链真核生物基本上没有操纵结构。 真核细胞基因大部分intervening sequences），因此，基因不连续的split gene）。 （一） 内含子与外显子 内含子（intron）是结构基因中的非编码序列，往往与编码序列呈间隔排列。当基因转录后，在mRNA的成熟过程中被剪切（splicing）。 外显子（exon）是结构基因中的编码序列，当基因转录后，mRNA在成熟过程中切去内含子，外显子才被拼接成完整的序列，成为成熟的mRNA作为指导蛋白质合成的模板。 （二） 间隔区DNA 真核生物基因之间存在编码空白区或转录的空白区，称之为间隔区DNA（spacer DNA），这些序列往往在单拷贝的结构基因之侧翼，并使结构基因彼此分开，间隔区DNA也可以存在于rDNA区。间隔区DNA大小与基因组的大小有关，一般来说，基因组愈大，间隔区DNA所占的比例也愈高。 四、重复序列 （一） 高度重复序列 真核生物基因组中普遍存在着重复序列中重复频率高，可达百万106）以上在基因组中约占20％。因此复性速很快。高度重复序又按其结构特点分为 1．反向（倒位）重复序列这种重复序复性速度极快，即使在极稀的DNA浓度下，也能很快复性，因此又称零时复性部分，人基因组约占5％。倒位重复序列由两个相同顺序的互补拷贝在同一DNA链上反向排列而成。变性后再复性时，同一条链内的互补的拷贝可以形成链内碱基配对形成发夹式或+”字形结构。倒位重复（即两个互补拷贝）间可有个核苷酸的间隔，也可以没有间隔。没有间隔的又称回文（palindrome），回文结构约占所有倒位重复的三分之一。卫星DNAsatellite DNA） 重复序重复单位一般由2~10bp组成，成串排列。由于这类序列的碱基组成不同于其他部份，可用等密度梯度离心法将其与主体DNA分开，因而称为卫星DNA或随体DNA。在人组中卫星DNA约占5~6％。高度重复顺序的功能参与复制水平调节反向序列常存在于DNA复制起点区的附近另外，许多反向重复序列是一些蛋白质（包括酶）DNA的结合位点。参与基因表达调控参与转位作用几乎所有转位因子的末端都包反向重复序，长度由几个bp到1400bp。与进化有关不同种属的高度重复序的核苷酸序列不同，具有种属特异性，但相近种属又有相似性体特征同一种属中不同个体的高度重复序的重复次数不一样，这可以作为每个体的特征，即DNA指纹与染色体减数分裂时染色体配对有关中度重复序列指在真核基因组中重复数十