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结构化学实验一 丙烯基自由基的各个碳原子是采用何种杂化方式 目的： 1. 学习构建分子结构的方法； 2. 学习g09 软件的基本使用方法； 3. 学习优化分子结构的方法； 4. 学习分子轨道图形的生成方法； 5. 学习分子稳定性的比较方法。 6. 通过计算确定丙烯基自由基的各个碳原子是采用何种杂化方式。 工具： 软件：Gaussview5，Gaussian09W 硬件：PC 机，windows 操作系统 原理： 1．问题的提出： 丙烯基自由基的可能结构如下图: 1 1 H3C 2 3 H4 H3C 2 3 4 C C C C H H H （a ）C 2 采取sp 杂化 （b ）C 采取sp 杂化 3 3 图1 丙烯基自由基的可能结构 3 2 在丙烯基自由基中，1，2 号C 原子分别采取sp ，sp 杂化形式，而3 号C 原子可能是 2 sp 杂化（a ），也可能是sp 杂化 （b ）形式。采用不同的初始构型，经过量子化学优化计算 后可以得到稳定的平衡几何构型。通过优化后的几何构型图形就可以看出3 号C 原子是采 用何种杂化形式。通过看图软件Caussview，可以看出分子轨道的形状，进而判断其各个分 子轨道是σ轨道、π轨道，还是其它形式。 2 ．计算方案： 通常可以采用下述三种方案中的一种进行理论研究。 １．半径验方案：关键词可以用“PM3 ”，它是比 HMO 好的半经验方法，其特点是计 算速度快。 ２．从头算方案：关键词可以用“HF ”，这时需要提供原子轨道线性组合成分子轨道的 基组，最小的基组用“STO-3G ”，推荐的基组为“6-31G(d) ”。后者比前者需要更多的计算 时间。同半经验方法相比，从头算的特点是结果可信度大。通常基组越高，结果也越可靠。 ３．密度泛函理论：关键词可以用“B3LYP ”，这是比较流行的密度泛函方案。同时也 要像从头算一样提供基组。通常在相同的基组下，密度泛函理论的计算时间与从头算相当， 但精度更高。 更多的关键词及基组信息可以参看“g09 软件使用手册”部分。 几个有用的关键词： OPT：做几何构型优化，通过优化可以得到分子的平衡几何构型，此时分子的能量最低。 Freq ：计算频率，得到红外、拉曼光谱。计算频率通常要同时做几何构型优化。 3 ．软件的作用： 1．Gaussview 软件可以构建分子的几何构型，并保存成 .gjf 格式的文件；可以看计算 结果 （.out 或者.log 为扩展名的文件）；也可以图形化分子的几何构型、电荷分布及轨道 （需 要.chk 为扩展名的文件）等信息。 2 ．G09 是一个计算软件包，它可以做半经验、从头算及密度泛函理论的计算。 实验步骤： 一． 建立模型 1．打开GaussView 软件：从开始菜单处找到GaussView 软件，如图2 ，单击打开。桌 面上会出现两个窗口，一个是“工具窗口”，另一个是“工作窗口”。 图2 如何找到画图软件GaussView ２．构造CH4 分子：双击 “工具窗口”左上角处的 图标。选择要建模型的一个骨架 碳原子，再选择相应的杂化形式。比如 1 号C