陆英hmgs 基因cdna 克隆、不同器官中的差异表达及生物信息学分析.pdf

• 1578 • 中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 9 期 2016 年 5 月 陆英 HMGS 基因 cDNA 克隆、不同器官中的差异表达及生物信息学分析 姚元枝，黎晓英，郭文博，刘 宇，魏 麟* 怀化学院生命科学系，民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室，湘西药用植物与民族植物学湖南省高校重点实 验室，湖南 怀化 418008 摘 要：目的 克隆陆英 Sambucus chinensis 3-羟基-3- 甲基戊二酰辅酶A 合成酶 （HMGS ）基因并分析其差异表达。方法 采 用实时荧光定量 PCR （RT-PCR ）方法获得HMGS 基因 cDNA 序列并对 HMGS 蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结 构预测分析，并预测了该蛋白功能；利用 RT-PCR 方法检测了 HMGS 基因在陆英的根状茎、地上茎、叶、花中的表达情况。 结果 克隆获得的 HMGS 基因 cDNA 全长为 1 401 bp，编码466 个氨基酸。生物信息学预测 HMGS 蛋白无跨膜区，不含信 号肽。HMGS 基因主要在陆英的花和根状茎中表达较高，在叶中表达相对较低。结论 首次从陆英中克隆了 HMGS 基因， 为进一步阐明该基因在陆英萜类化合物代谢途径中的重要作用奠定基础。 关键词：陆英；3-羟基-3- 甲基戊二酰辅酶A 合成酶；萜类化合物；差异表达；克隆 中图分类号：R282.12 文献标志码：A 文章编号：0253 - 2670(2016)09 - 1578 - 05 DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2016.09.022 cDNA cloning, difference expression in various organs, and bioinformatic analysis of HMGS gene in Sambucus chinensis YAO Yuan-zhi, LI Xiao-ying, GUO Wen-bo, LIU Yu, WEI Lin Key Laboratory of Research and Utilization of Ethnomedicinal Plant Resources of Hunan Province, Key Laboratory of Xiangxi Medicinal Plant and Ethnobotany of Hunan Higher Education, Huaihua University, Department of Life Sciences, Huaihua University, Huaihua 418008, China Abstract: Objective To clone 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A synthetase (HMGS) gene from Sambucus chinensis and analyze the difference expression. Methods The sequence of HMGS gene was cloned from S. chinensis by using RT-PCR strategy. The physiochemical properties, secondary structure, and three-dimensional structure of HMGS protein were forecasted and analyzed, and its structure and function were predicted. And the difference expression of HMGS gene in the rhizome, stems, leaves, and flowers of S. chinensis was analyzed by fluorescent quantitative PCR. Results The cDNA contains a 1 401 bp open reading frame and encodes a p