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- 2017-09-02 发布于天津
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介观模拟研究温度对dppc磷脂双层膜结构的影响 - 中药信息工程研究
第32卷第5期 计算机与应用化学 V01.32,No.5
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介观模拟研究温度对DPPC磷脂双层膜结构的影响
尹倩倩1,史新元扩,丁海欧1,戴幸星2,乔延江2+
(1.首都医科大学中医药学院,北京,100069;
2.北京中医药大学中药信息7-程研究中心,北京,100102)
摘要:生物膜作为生物体的一种基本组成单元,在各种生命活动中占据重要地位。生物膜的结构和功能的稳定性是其发挥一切
生理功能的前提。本文以DPPC磷脂双分子层为生物膜模型,采用基于Martini力场的粗粒化模拟方法,考察了温度对DPPC
磷脂双层膜结构、形态和功能的影响。结果表明,315K为DPPC磷脂双层膜的相转变温度;温度升高,DPPC分子间隙增加,
尾链发生折叠弯曲,引起脂均面积增大,厚度减小,流动性增加;DPPC双层膜中甘油酯基团组成的栅栏区为膜中分子排列最
有序的区域,也是阻碍小分子透膜的主要屏障区。研究结果不仅有助于更好地阐释生物膜的结构形态和功能之间的关系,也有
助于理解药物与膜的相互作用,指导临床用药。
关键词:DPPC;相转变温度;流动性;介观模拟;Martini力场
中图分类号:0641 文献标识码:A
DoI:10.11719/com.app.che
1 引言 磷脂双分子层是构成生物体膜结构的基本骨架,膜
的流动性与脂质分子在膜中的运动及排布形式密切相
生物膜结构是生物体重要的组成单元之一,生物体
关[17】。二棕榈酰磷脂酰胆碱(DPPC)是大多数哺乳动物细
内许多生命活动都与膜结构有关,如物质转运、能量转
胞膜的主要成分,由于其相变温度接近生理温度,近年
换、信号识别与传递掣11。生物膜结构的稳定性及流动性
来作为模拟生物膜的模型而被广泛应用。本文以DPPC
是其发挥正常生理功能的前提。在生理状态下,处于液
磷脂双分子层为载体,采用基于Martini力场的介观模拟
晶态,既保留了晶态分子的有序排列,又具有液态分子
方法探讨温度对生物膜结构、形态和功能的影响,为深
的流动性[2卅。外界温度的变化会影响膜的流动性,因此
入认识生物膜中的有序结构及研究药物与生物膜的相互
研究温度对生物膜结构的影响,对于进一步理解生物膜
作用奠定基础。
的结构和功能,探索与细胞膜相关的生命活动的内在机
制,及更好地发挥药物的治疗作用有着非常重要的意义。 2 实验部分
随着现代分析技术的快速发展,许多新技术逐渐被
2.1模型的搭建
用于生物膜领域的研究,主要有电磁波谱法【5’7】、显微镜
本文所有模拟工作均基于Materials
技术【8】、以及差示扫描量热技术【91、电子自旋共振法【lo】、
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