α-synuclein蛋白与a-β肽和β-synuclein蛋白相互作用位 - 上海大学学报.pdfVIP

第１８卷 第２期 （自然 科 学 版） Ｖｏｌ．１８Ｎｏ．２ ２０１２年４月 ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＳＨＡＮＧＨＡＩＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ（ＮＡＴＵＲＡＬＳＣＩＥＮＣＥ） Ａｐｒ．２０１２ 　　ｄｏｉ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００７２８６１．２０１２．０２．０１３　 ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ蛋白与Ａ肽和 ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ蛋白 α β β 相互作用位点的预测 １ ２ １ 王群群 ，　答　亮 ，　王翼飞 （１．上海大学 理学院，上海２００４４４；２．中国科学院上海生命科学研究院，上海２０００３１） 摘要： ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ蛋白的异常聚集是引起帕金森病的重要因素．实验研究发现，ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ蛋白能与多个蛋白相互 α α 作用．在相互作用的蛋白质中，有的可以促进 ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ的异常聚集，如Ａ肽；有的可以抑制 ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ的异常 α β α 聚集，如 ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ蛋白，但促进或抑制 ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ异常聚集的机理并不明确．利用ＳＹＢＹＬ和ＡＵＴＯＤＯＫ软件模拟 β α ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ蛋白与Ａ肽和 ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ的相互作用，找到其相互作用位点，为进一步研究 ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ蛋白的异常聚 α β β α 集提供理论依据． 关键词： ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ蛋白；Ａ肽；ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ蛋白；同源建模；分子对接；活性位点 α β β 中图分类号：Ｑ８１　　　　　文献标志码：Ａ　　　　　文章编号：１００７２８６１（２０１２）０２０１７８０５　 ＰｒｅｄｉｃｔｉｏｎｏｆｓｙｎｕｃｌｅｉｎｗｉｔｈＡＰｅｐｔｉｄｅａｎｄ ｓｙｎｕｃｌｅｉｎＩｎｔｅｒａｃｔｉｏｎＳｉｔｅｓ α β β １ ２ １ ＷＡＮＧＱｕｎｑｕｎ，　ＤＡＬｉａｎｇ，　ＷＡＮＧＹｉｆｅｉ （１．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＳｈａｎｇｈａｉＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｓｈａｎｇｈａｉ２００４４４，Ｃｈｉｎａ； ２．ＳｈａｎｇｈａｉＩｎｓｔｉｔｕｔｅｓｆｏｒＢｉｏｌｏｇｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｓｈａｎｇｈａｉ２０００３１，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＴｈｅａｂｎｏｒｍａｌａｇｇｒｅｇａｔｉｏｎｏｆｓｙｎｕｃｌｅｉｎｐｌａｙｓａｎｅｓｓｅｎｔｉａｌｒｏｌｅｉｎｔｈｅＰａｒｋｉｎｓｏｎ’ｓｄｉｓｅａｓｅ．Ａ α ｒｅｃｅｎｔｓｔｕｄｙｄｅｍｏｎｓｔｒａｔｅｓｔｈｅ ｓｙｎｕｃｌｅｉｎｍａｙｉｎｔｅｒａｃｔｗｉｔｈｍａｎｙｄｉｆｆｅｒｅｎｔｐｒｏｔｅｉｎｓｓｕｃｈａｓＡｐｅｐｔｉｄｅ α β ａｎｄ ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ．Ａ ｐｅｐｔｉｄｅｐｒｏｍｏｔｅｓａｂｎｏｒｍａｌａｇｇｒｅｇａｔｉｏｎｏｆ ｓｙｎｕｃｌｅｉｎ．Ｈｏｗｅｖｅｒ， ｓｙｎｕｃｌｅｉｎｉｓ β β