罗氏HIV-1 定量检测引物SK145 和SKCC1B 的评估及优化 - 天恩泽.PDFVIP

24 1 ( ) Vol． 24 No． 1 第 卷第 期 江苏大学学报 医学版 2014 1 Journal of Jiangsu University (Medicine Edition) Jan． 2014 年 月 罗氏HIV-1 定量检测引物SK145 和SKCC1B 的评估及优化 1，2 1 1 1，2 ， ， ， 樊路娟 张春霞 徐庆刚 张驰宇 (1． ， 2120 13 ;2 ． ， 200025) 江苏大学生命科学研究院 江苏镇江 中国科学院上海巴斯德研究所 上海 ［ ］ : HIV-1 SK145 SKCC1B HIV-1 摘要 目的 评估罗氏 检测系统中引物 和 对不同亚型 病毒定量检测的广谱性及准确 ， 。 : 5 HIV-1 (B 、C、A 、01_AE 、D) SK145 性 并在此基础上对该引物进行优化 方法 下载并分析 个主要 流行亚型 在引物 SKCC1B ， 5 。 HIV-1 和 扩增区段的对应序列 从各亚型筛选出所占比例最高的 条序列构建定量标准品 用梯度稀释的 SK145 SKCC1B 。 SK145 SKCC1B HIV-1 各亚型标准品来评估引物 和 的扩增效率 为改善引物 和 对 不同亚型扩增的准 ， 。 : SK145 、SKCC1B 确性和广谱性 我们重新设计了一对简并引物并分析其对不同亚型病毒的扩增效果 结果 引物 对 B ， B ， HIV-1 于 亚型病毒的扩增效果最好 而对非 亚型病毒的扩增效果并不理想 简并引物能显著改善对各亚型 病毒 。 : SK145 SKCC1B B HIV-1 ， 扩增的效果 结论 罗氏引物 和 不适用于非 亚型 病毒载量的定量检测 而优化设计的简并 HIV-1