智慧计算学门 - 科技部工程科技推展中心.pdfVIP

生物資訊與醫療資訊領域領域規劃 251 智慧計算學門 生物資訊與醫療資訊領域領域規劃 生物資訊領域規劃 253 智慧計算學門 生物資訊領域規劃 參與規劃教授(按姓氏筆劃序排列): 洪炯宗教授 許聞廉教授 黃憲達教授 楊昌彪教授 楊進木教授 熊 昭教授 趙坤茂教授 陳倩瑜教授 陳豐奇教授 蔣榮先教授 歐陽彥正教授 生物資訊領域規劃 255 領域概述 人類基因體與生命科學相關研究過程中產生的大量資料，不僅在科學上帶來革命性 的影響 ，同時也刺激了跨領域的研究 。大量的資料使分析與進一步研究變得困難 ，但在 結合資訊技術之後 ，不僅改進了這些資料的分析效率與可應用性 ，亦能自分析出來的資 料更進一步地衍生新的研究課題 ，進而成為一個嶄新的領域－生物資訊。生物資訊是現 今資訊科學中最重要的跨領域研究之一。生物資訊的研究方法不僅結合傳統的生物實驗 技術與電腦計算的優勢 ，更需要進一步地進行分析與應用大量的資料 ，來有效地解決生 物的問題。就跨領域學科而言 ，生物資訊結合生物、資訊 、統計、數 學、物理及化學等 領域 ，以計算的方法探討生物相關的研究課題。重要的問題包括 ：基因表現之預測及表 達 、蛋白質結構與功能及序列之間的關聯性 、生物分子反應模擬、分子演化之分析、生 物文獻搜尋與萃取、基因網路之模擬與構建、乃至基因時間序列分析、藥物反應與代謝 過程 、整個生物反應路徑 、系統之構建、個人專用藥物設計等 。 此外為了能有效利用電腦來儲存與分析生物學家由實驗所得到的生物相關資料 ，如 核酸序列 、胺基酸序列 、蛋白質結構 、基因資訊、基因表現資料、基因表現時間序列資 料等 ，使得生物資訊研究領域近年來蓬勃發展 。若能有效地分析這些資 料並且整理出其 中的規則所在 ，將可能找出各種生物之間的關聯性 ，例如 ，演化樹的建構與各種生物族 群的從屬關係 。若能解讀生物序列上的基因功能 ，就可找出功能異常的部分 ，進而推知 疾病的發生原因 ，並設法研製對應的藥物。透過人體基因對藥物反應的結果 ，甚至可以 設計供個人專門使用的客製化藥物 。然而，現今生物資訊的研究仍面臨許多挑戰 。以生 醫文獻探勘中的專有名詞辨識技術為例 ，在給定某一特定基因為目標進行搜尋時 ，往往 因不同文獻作者對相同基因採用不同名稱 ，造成搜尋上的不便 。因此 ，在生物資訊的研 究上 ，如何讓電腦對生物相關資料進行正確的分析 ，達到高準確度的結果預測 ，一直是 非常重要的研究課題 。在生物資訊的研究中 ，目前國際較具知名度的期刊有 PLOS Computational Biology 、PLOS ONE 、Bioinformatics 、Journal of Computational Bi