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现代分子生物学4章
Chapter 4 DNA Replication 内容提要 第一节 概述 第二节 细菌DNA的复制 第三节 真核DNA的复制 第四节 端粒复制 第五节 其他DNA复制方式 第一节 DNA复制的概述 半保留复制 复制的起点和方向 DNA的半不连续复制 RNA引物 DNA复制的酶体系 DNA合成的高保真性 一、半保留复制 (Semi-conservative Replication) 1、半保留模型的提出: 1953 Watson Crick: DNA双螺旋模型; DNA 复制的半保留模型 2、 DNA复制的三个模型: 半保留模型; 全保留模型; 分散模型 4、半保留复制机制 复制时DNA双螺旋的两条链解开,并分别作为模板指导互补链的合成。每个子代DNA的一条链来自亲代的DNA,另一条链则是新合成的 。 二、复制的起点和方向 1、复制起点 (origin): 复制起始处的特定DNA序列 2、复制终点(termini): 复制终止处的特定DNA序列 3、复制子(replicons ): DNA复制起点到两端终点的DNA单位 原核生物基因组:一个复制子 真核生物基因组:多个复制子 4、复制方向: 双向复制:单一起点的双向和多起点的双向 (腺病毒:单向) 双向复制(Bidirectional replication) 在同一复制起点两个复制叉以相反的方向移动 单向复制(Unidirectional replication) 单个复制叉从复制起点处向一个特定方向移动 复制叉 replication fork 双螺旋DNA 两条亲本链分开使复制进行的部位 复制泡 replication bubbles 复制时,两个复制叉合起来像一个小泡 5、复制的速度: 原核生物:50000bp/min 真核生物:1000~3000bp/min Continuous, semidiscontinuous, and discontinuous models of DNA replication 三、 DNA的半不连续复制 1968年,Okazaki,半不连续复制模型 1、半不连续复制(semidiscontinuous replication) 前导链的连续合成和滞后链的不连续合成的复制模式 2、前导链(leading strand) 以5¢-3¢方向连续合成的DNA 链 3、滞后链(lagging strand) 总体上沿着3¢到5¢方向延伸,但以小片段形式(5¢-3¢)不连续合成,最后共价连接起来 4、冈崎片段(Okazaki fragment) 在不连续复制中产生的短片段,随后被连接成完整的链 E.coli 1000-2000nt 真核生物 100-200nt 四、RNA引物(RNA primer) 1、定义 与一条DNA链配对的短核苷酸序列 (通常是RNA),提供自由3¢-OH末端,使DNA聚合酶开始合成DNA链。 2、功能 RNA引物可以提供3’-OH末端作合成新DNA链起点; 提高了DNA复制的准确性。 3、引发活动 前导链 (leading strand): 引发酶(primase) 滞后链 (lagging strand): 引发体(primosome) 引发酶:在DNA复制中合成RNA引物的一种RNA聚合酶 引发体:指在半不连续DNA复制中,每个岗崎片段合成引发反应中涉及的蛋白质复合体。引发体能沿着DNA 移动,参与连续的引发反应。 五、DNA复制的酶体系 (一)参与DNA复制的蛋白质 1、DNA解旋酶(DNA helicase) 作用:解开双链;ATPase Dna B (E. coli ) 2、单链结合蛋白(ssb) 作用:防止单链退火 (在原核细胞中表现出协同效应) 3、引发酶(primase):如Dna G (E. coli ) 4、DNA连接酶(DNA ligase) 催化DNA链的两个末端的共价连接; 需要能量:NAD(E. coli )/ ATP(真核) 5、拓扑异构酶 6、DNA聚合酶 (二)DNA聚合酶催化的聚合反应 1、以脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)为底物催化合成DNA 2、需要模板(3’ → 5’)和引物的存在 3、不能从头合成新的DNA链(必须有3 ’ -OH末端) 4、催化dNTP加到生长中的DNA链的3’
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