甘蔗线条花叶病毒hc-pro基因的分子变异分析参考.pdfVIP

勉扬锯力2017，43(2)：29—36 P￡n，z￡Pro￡ec￡io咒 甘蔗线条花叶病毒黔P胁基因的分子变异分析 贺 振L2， 李文凤3， 张志想2， 李世访2。 (1．扬州大学园艺与植物保护学院，扬州225009；2．中国农业科学院植物保护研究所／植物病虫害生物学国家 661699) 重点实验室，北京 100193；3．云南省农业科学院甘蔗研究所／云南省甘蔗遗传改良重点实验室，开远 摘要为了解析甘蔗线条花叶病毒S“gnM硎P 规律，本研究利用ImPCR法扩增获得SCSMVHC_Pro基因的序列，通过生物信息学分析，分别从重组、系统发生、 HC-Pro基因序列，相似性最 选择压力等方面研究scsMVHC_Pro基因的分子变异特征。共测定了44条scsMV 低值为70％；HGPro基因重组频率较低，仅发现3个重组位点，其中一个系首次报道；与先前报道相比，部分新测 用，未发现正向选择作用位点。本研究结果进一步证明SCSMVHC-Pro基因具有高度的遗传多样性。 关键词甘蔗线条花叶病毒； HC-Pro基因；分子变异 中图分类号： S435．661文献标识码： A DoI：10．3969／j．issll．0529—1542．2017．02．005 MolecularVariationofHC-Proof sf陀nkmDs口fc订rMs geneSh舶M，zP }Ie Li Li Zhenl’2， Wenfen93，ZhangZhixian92，Shifan92 (1．＆矗oDf 0厂协ⅢcMffMre口蒯P肠nfP幻把cfion，砌ngz九o“‰i比捌fy，砀孵矗o“225009，叻i砌；2．s№把K哕 Di黝鲫口，zd L口幻mfo秽如髓DfDgyo，Pf册fJn船cf鼢捃，砌咖M把o，胁nfPmf∞ffo儿，劬i，z黜4∞d绷yD，如啦M胁mf ＆i已nc甜，玎嘲 RB蚴阳矗如鲥m把，l钆凡凇n 661600，@i砌) A∞d唧yo厂A州cMff“mfiP凡c船，瓦ziy凇n AbstractThe ofthis istoassessthemolecularevolutionand ofscsMV to objectivestudy divergence according HC—Pro HCPro ofSCSMVwereobtainedRT—PCR，and genesequences．Thegenesequences by analyzedby bioinformatic of flow．Inthe software，in aspect gene HC—Pro weredeterminedwitha70％lowest onenovelrecombi· presentstudy，44 genesequences similarity；only nationsite withtwo inHC—Pro that re—