烟草cms相关基因orf25的生物信息学分析 - 中国农学通报.pdf

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烟草cms相关基因orf25的生物信息学分析 - 中国农学通报

中国农学通报 2011,27(05):312-316 Chinese Agricultural Science Bulletin 烟草CMS相关基因orf25的生物信息学分析 1 1 1 2 周 玮 ,黄 河 ,周伯楠 ,刘齐元 1 (湖南农业大学生物安全科学技术学院,长沙410128 ; 2 江西农业大学农学院/作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室,南昌330045) 摘 要:线粒体基因orf25 异常可能导致烟草细胞质雄性不育(CMS )。为探讨orf25 基因导致CMS 的可 能机理,本文采用生物信息学方法,分析烟草雄性不育系‘MS 革新3 号’及其保持系中的orf25 基因在其 编码蛋白各结构层次上存在的差异。结果显示,不育系中orf25 基因因碱基改变提前出现终止子从而导 致其编码蛋白缺失结构域,这极可能成为干扰线粒体F(0)F( 1)-ATP 合成酶功能的关键因素,从而成为导 致烟草‘革新3 号’CMS 的根本原因之一。 关键词:烟草;细胞质雄性不育(CMS );orf25 基因;生物信息学;不育机理 中图分类号:Q71 文献标志码:A 论文编号:2010-2729 TheBioinformaticsAnalysisoforf25GeneRelatedtoTobaccoCytoplasmicMaleSterility 1 1 1 2 Zhou Wei , Huang He , Zhou Bonan , Liu Qiyuan 1 ( CollegeofBio-safetyScienceandTechnology, HunanAgriculturalUniversity, Changsha 410128; 2 CollegeofAgronomy, JiangxiAgriculturalUniversity/KeyLaboratoryofCropPhysiology, EcologyandGeneticBreeding, MinistryofEducation, Nanchang 330045) Abstract: It was reported that aberrant mitochondrial gene orf25 might cause tobacco cytoplasmic male sterility (CMS). To understand the mechanism of CMS, the differences of orf25 gene between CMS line ‘Gexin 3 ’and its maintainer line were analyzed by bioinformatics at different structure levels of coding protein. The results showed that the terminal codon appeared early because of the base change in the orf25 gene, which

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