基于多模集成神经网络的蛋白质二级结构预测 - 四川理工学院学报.pdf

24 6 Vol. 24 No. 6 第 卷第 期 ( ) 四川理工学院学报 自然科学版 20 11 12 Journal of Sichuan University of Science ＆ Engineering (Natural Science Edition) Dec. 2011 年 月  文章编号:1673-1549 (20 11)06-0666-05 基于多模集成神经网络的蛋白质二级结构预测 ， ， ， 李林江 伍勇强 曾黄麟 张金山 ( ， 643000) 四川理工学院理学院 四川 自贡 : ， 5 摘 要 为提高蛋白质二级结构预测的精度 提出了一个由 个子网络集成的多模神经网络模 ， 5 。 ， 型 预测结果由 个子网络综合得到 对于每个子网络采用神经网络分级思想分为二级网络 一级网 profile ， 。 络采用含进化信息的 编码蛋白质序列作为输入 二级结构作为输出 二级网络编码一级网络 ， ， 输出结果作为输入 并将蛋白质序列用改进正交编码方式作为另一输入来提高二级网络的预测精度 。 ， 7 1． 输出仍为二级结构 采用子网络差异方式进行单独训练 结果表明该方法最终的预测精度达到 3% ， 。 较大提高了蛋白质二级结构的预测精度 : ; ; ; 关键词 神经网络 二级结构预测 改进正交编码 预测精度 中图分类号:TP183 文献标识码:A profile 编码是两种最常用的编码方式。 引 言 20 ， 1， 正交编码用 位二值节点编码 依次使一位为 蛋白质二级结构的预测是生物信息学中一个重要 0 ， 20 ， H 其余位为 即可表示 种氨基酸 如代码为 的组氨 T ， 的课题 进行二级结构