实时荧光定量pcr(taqman)法测定外源基因的拷贝数.pdf

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实时荧光定量pcr(taqman)法测定外源基因的拷贝数

广 西 植 物 Guihaia 29(3):408—412 2009年 5月 实时荧光定量 PCR(TaqMan)法 测定外源基因的拷贝数 王爱民1, (1.徐州师范大学 生命科学学院,江苏 徐州 221116;2.江苏省药用植物生物技术重点实验室 ,江苏 徐州 221116) 摘 要:实时荧光定量 PCR是近年新兴的一项技术 ,因其快速、方便、便宜,需要 DNA样品量少 ,无需放射性 检测等优点被广泛应用于基因的定量分析。该文就实时荧光定量 PCR(TaqMan)技术的发展、基本原理及测 定外源基因拷贝数的技术流程做一介绍。 关键词:外源基因;拷贝数;实时荧光定量PCR 中图分类号 :Q943 文献标识码 :A 文章编号 :1000—3142(2009)03—0408-05 E…stimati·●ngcopyam h’er0tntransgem●cgeneb’y real-timefluorescentquantitativePCR(TaqMan) Ⅵ NG Ai—Min1,2 (1.SchoolofLifeScience,XuzhouNormalUniversity,Xuzhou221116,China;2.JiangsuProvincial KeyLaboratoryofBiotechnologyforMedicinalPlant,Xuzhou221116,China) Abstract:Real-timefluorescentquantitativePCRiSanewtechniquewhichhasbeendevelopedtObeusedinquantita— tiveanalysisofgenesaswellwiththeadvantagesofsimpleness,quickness,shortneedsoftargetfragmentDNA and noneofhazardousradioisotopesinrecentyears.Thedevelopment,theprincipleofreal—timefluorescentquantitative PCR(TaqMan)andthetechinicalflow ofestimatingcopynumberoftransgenicgeneareintrouducedinthispaper. Keywords:transgenicgene;copynumber!real—timefluorescentquantitativePCR 传统测定基因拷贝数的方法是 SouthernBlot— (1)不需要进行 PCR的后处理,最大限度的减少 了 ting。事实证明它确实是一个行之有效的、准确的 操作过程中可能导致的污染;(2)快速 ,便宜;(3)避 方法,但在实际操作过程 中我们也不难发现,它费 免使用具有危害的放射性同位素;(4)仅需要少量的 时、费力,同时还需大量的DNA样 品,甚至要使用 DNA样品;(5)提供一个广泛的定量动力学范围,能 放射性同位素(Mason等,2003)。近年兴起的实时 对拷贝数差异较大的不同样品进行精确定量。由于 荧光定量 PCR(real—timequantitativepolymerase 该技术不仅实现 了PCR从定性到定量的飞跃 ,而且 chainreaction,real—timequantitativePCR)技术弥 与常规 PCR相 比,它具有特异性更强、有效解决 补了以上的不足 (Ingham等 ,2001;Song等,2002; PCR污染问题、自动化程度高等特点,目前已得到 Mason等,2003)。实时荧光定量 PCR技术是在 广泛应用。 1996年由美国AppliedBiosystems公司推 出,它通 过在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号

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