cDNA 微阵列结合聚类分析探讨大鼠心肌缺血2再灌诱导的基因表达谱.PDF

( ) 中南大学学报 医学版 　2004 ,29 (3) ( ) 252 J Cent South Univ Med Sci cDNA 微阵列结合聚类分析探讨大鼠心肌 缺血再灌诱导的基因表达谱改变 袁 　灿 ,赵震宇 ,刘 　瑛 , 吕青兰 ,王秋鹏 , 肖献忠 ( 中南大学湘雅医学院病生教研室 ,长沙 410078) [摘要] 　目的:探讨大鼠心肌缺血再灌诱导的基因表达谱改变 ,为揭示心肌内源性保护的分子机制提供新的线 索和思路 。方法 :采用反复短时间结扎及松解左冠状动脉主支构建大鼠心肌缺血再灌反应动物模型 ,运用含4 097 ( ) 个大鼠基因点的 cDNA 芯片检测大鼠心肌缺血再灌处理后不同时间点 1 ,3 ,6 , 12 ,24 h 的基因表达情况 ,并采用 SOM 算法将具有相似表达模式的基因进行聚类 。结果 :短时间缺血后再灌 1 ,3 ,6 ,12 ,24 h 分别有 75 ,779 ,205 ,155 ,166 个基因表达发生改变 。具有相同表达模式的基因被聚为 12 类 。结论 :心肌缺血再灌可以诱导心肌的基因表达谱发 生改变 ,具有相似表达模式的基因可能具有相似的功能或相似的表达调控机制 。 [ 关键词] 　心肌缺血再灌 ; 　基因表达 ; 　cDNA 芯片 ; 　聚类分析 ( ) [ 中图分类号] 　R543 . 31 　　　　[文献标识码] 　A 　　　　[文章编号] 2004 Dyna mic pattern of gene expression in rat hearts responding to transient ischemia/ reperf usion detected by cD NA microarray and cluster analysis ·· YUAN Can ,ZHAO Zhenyu ,L IU Ying ,LU Qinglan ,WAN G Qiupeng ,XIAO Xianzhong