基于磁珠富集法开发并筛选西川红景天的微卫星标记-广西植物.PDF

ｈｔｔｐ：／ ／ ｊｏｕｒｎａｌ．ｇｘｚｗ．ｇｘｉｂ．ｃｎ － 　 Ｇｕｉｈａｉａ　 Ｍａｒ． ２０１７，３７（３）：３４２ ３４７ － ｈｔｔｐ：／ ／ ｗｗｗ．ｇｕｉｈａｉａ ｊｏｕｒｎａｌ．ｃｏｍ ＤＯＩ：１０．１１９３１／ ｇｕｉｈａｉａ．ｇｘｚｗ２０１６０３０２５ － 引文格式：王久利，雷淑芸，陈世龙，等．基于磁珠富集法开发并筛选西川红景天的微卫星标记 ［Ｊ］． 广西植物，２０１７，３７（３）：３４２ ３４７ ＷＡＮＧＪＬ，ＬＥＩ ＳＹ，ＣＨＥＮ ＳＬ，ｅｔ ａｌ． Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ａｎｄ ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ ｏｆ ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒｓ ｉｎＲｈｏｄｉｏｌａ ａｌｓｉａ ｗｉｔｈ ｍａｇｎｅｔｉｃ ｂｅａｄｓ ｍｅｔｈｏｄ ［Ｊ］． Ｇｕｉｈａｉａ，２０１７，３７ － （３）：３４２ ３４７ 基于磁珠富集法开发并筛选西川红景天的微卫星标记 １，２ １，２ １ １∗ 王久利 ，雷淑芸 ， 陈世龙 ，张发起 （ １． 中国科学院高原生物适应与进化重点实验室，中国科学院西北高原生物研究所，西宁８１０００１；２． 中国科学院大学，北京 １０００３９ ） 摘　 要：利用ＦＩＡＳＣＯ磁珠富集法，开发和筛选青藏高原特有珍贵植物西川红景天（Ｒｈｏｄｉｏｌａ ａｌｓｉａ）多态性微 卫星标记。 结果表明：用（ＡＧ）１５和（ＡＣ）１５两种微卫星标记探针构建富集文库，共获得阳性克隆约２５００个； 从中随机挑取１２００检测，发现具有多态性的阳性克隆达４００个；随机挑取２００多态性的阳性克隆进行测序，从 中获得 １０５个ＳＳＲ位点，用在线软件ｐｒｉｍｅｒ３⁃２．３．４成功设计得ＳＳＲ引物 １０５对；其中４５对可以成功扩增，而 １３对所扩增的片段在相距较远的４个自然居群的２４个个体中显示较高的遗传多态性。 用４个居群的８０个 个体检测这 １３对引物发现，平均等位基因数（Ａ）约为９．１９２，观测杂合度（Ｈｏ）和期望杂合度（Ｈｅ）均值分别约 为０．７１２和０．７３４，如此高的多态性已经满足后期研究的需要；数个位点在某些居群中显著偏离哈迪温伯格平 衡（Ｐ＜０．０１），这可能是实际研究的居群并不能达到哈迪—温伯格定律所假设的无限大等理想状态所致。 结 合此前基于表达序列标签（Ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ＳｅｑｕｅｎｃｅＴａｇ，ＥＳＴ）序列开发的ＳＳＲ多态性位点，该研究结果为今后利用 ＳＳＲ位点开展西川红景天的居群遗传结构分析和其他研究提供了一组有效工具。 关键词：西川红景天，微卫星，引物，磁珠富集法，开发 中图分类号：Ｑ９４１，Ｑ９４８　 　 文献标识码：Ａ　 　 文章编号：１０００⁃３１４２（２０１７）０３⁃０３４２⁃０６ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ａｎｄ ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ ｏｆ ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒｓ ｉｎ Ｒｈｏｄｉｏｌａ ａｌｓｉａ ｗｉｔｈ ｍａｇｎｅｔｉｃ ｂｅａｄｓ ｍｅｔｈｏｄ １，２ １，２ １ １∗ ＷＡＮＧＪｉｕ⁃Ｌｉ ，ＬＥＩ Ｓｈｕ⁃Ｙｕｎ ，ＣＨＥＮ Ｓｈｉ⁃Ｌｏｎｇ ，ＺＨＡＮＧ Ｆａ⁃Ｑｉ （ １．Ｋｅｙ ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ａｄａｐｔｉｏｎ ａｎｄＥｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ＰｌａｔｅａｕＢｉｏｔａ，Ｎｏｒｔｈｗｅｓｔ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ ＰｌａｔｅａｕＢｉｏｌｏｇｙ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃ