蛋白质机构与功能.docVIP

浅谈蛋白质的结构与功能 蛋白质是生命活动的物质，它广泛存在于植物、动物、微生物中，具有重要的生物学作用。蛋白质的氨基酸序列决定了蛋白质的空间结构和功能的基础，蛋白质的空间结构的正确折叠决定了蛋白质的生物学功能。20 种氨基酸残基组成的单链或多链多肽。通常，把含50 个氨基酸残基以上者称为蛋白质，含50 个氨基酸残基以下者则常常被称为多肽（polypeptide）。 1 蛋白质分子的结构层次蛋白质具有特定和高度有序的结构。 蛋白质的分子结构有4 个层次，即一级、二级、三级和四级结构。 一级结构是指蛋白质肽链中的氨基酸共价结合的排列顺序，是最基本的结构。二级结构是指肽链骨架原子即氨基氮和碳原子的相对空间位置，主要包括α- 螺旋、β- 折叠、β-转角和无规则卷曲，并不涉及侧链基团的构象。由于分子量很大，一个蛋白质分子可含有多个或多种二级结构。三级结构是指肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，包括每一个原子在三维空间的排列位置。三级 结构的形成和稳定主要靠非共价键，包括疏水键、离子键（盐键）、氢键和范德华引力等。例如，疏水性氨基酸的侧链疏水基团，具有避开水分子，相互聚集并将自身藏于蛋白质分子内部的自然趋势，这种结合力叫疏水键，帮助蛋白分子内部形成疏水区域。 由单条肽链形成的蛋白质只有一级、二级和三级结构。然而，细胞内许多蛋白质分子含有2 条或多条肽链才能全面地执行功能，单独的1条肽链一般没有生物学功能。每条肽链都有完整的三级结构，称为蛋白质的亚基（subunit）。这种蛋白质分子的各个亚基的空间位置及亚基接触部位的布局，即是蛋白质的四级结构。在四级结构中，各亚基间的结合与维持力主要是氢键和离子键等非共价键， 但有时共价键对2 个亚基的连接也起十分重要的作用。例如，胰岛素蛋白分子由A、B 2 条肽链组成，除了A 链内部有1 个二硫键，A 链和B链之间也通过2 个二硫键连接在一起；免疫球蛋白的轻链（亚基）和重链（亚基）之间的结合，也是靠链间二硫键实现的。 蛋白质的基本单位为氨基酸，而蛋白质的一级结构指的就是其氨基酸序列，蛋白质会由所含氨基酸残基的亲水性、疏水性、带正电、带负电等等特性通过残基间的相互作用而折叠成一立体的三级结构。虽然蛋白质可在短时间中从一级结构折叠至立体结构，研究者却无法在短时间中从氨基酸序列计算出蛋白质结构，甚至无法得到准确的三维结构。因此，研究蛋白质折叠的过程，可以说是破译“第二遗传密码”——折叠密码(folding code)的过程。 结构决定功能，仅仅知道基因组序列并不能使我们充分了解蛋白质的功能，更无法知道它是如何工作的。蛋白质可凭借相互作用在细胞环境(特定的酸碱度、温度等)下自己组装自己，这种自我组装的过程被称为蛋白质折叠。 蛋白质折叠问题被列为“21世纪的生物物理学”的重要课题，它是分子生物学中心法则尚未解决的一个重大生物学问题。从一级序列预测蛋白质分子的三级结构并进一步预测其功能，是极富挑战性的工作。 自从20世纪60年代，Anfinsen基于还原变性的牛胰RNase在不需其他任何物质帮助下，仅通过去除变性剂和还原剂就使其恢复天然结构的实验结果，提出了“多肽链的氨基酸序列包含了形成其热力学上稳定的天然构象所必需的全部信息”的“自组装学说”以来，随着对蛋白质折叠研究的广泛开展，人们对蛋白质折叠理论有了进一步的补充和扩展。Anfinsen的“自组装热力学假说”得到了许多体外实验的证明，的确有许多蛋白在体外可进行可逆的变性和复性，尤其是一些小分子量的蛋白，但是并非所有的蛋白都如此。而且由于特殊的环境因素，体内蛋白质的折叠远非如此。 体内蛋白质的折叠往往需要有其他辅助因子的参与，并伴随有ATP的水解。因此，Ellis 于1987年提出了蛋白质折叠的“辅助性组装学说”。这表明蛋白质的折叠不仅仅是一个热力学的过程，显然也受到动力学的控制。有的学者基于有些相似氨基酸序列的蛋白质具有不同的折叠结构，而另外一些不同氨基酸序列的蛋白质在结构上却相似的现象，提出了mRNA二级结构可能作为一种遗传密码从而影响蛋白质结构的假说。 从2006年开始，中心与美国麻省理工学院的著名统计物理学家黄克孙先生合作提出研究蛋白质折叠的“CSAW” 模型，实现了对中小型蛋白质结构的快速折叠;近期进一步开展了对蛋白质折叠统计热力学原理的研究。通过研究原子、分子间相互作用，掌握蛋白质系综内部微观状态的结构特征、能量分布规律，以期从微观角度解释宏观可观测物质属性。 (conformation)，是蛋白质功能多样性的结构基础。一级结构可理解为氨基酸排列的一维线性结构， 高级结构可理解为蛋白质分子中各个基团的三维空间结构。与稳固的一级结构不同，蛋白质的高级结构只具有相对的稳定性，可以发生程度不等的变化，导致蛋白质构象改变，从而可使蛋白质正在执行的生理功能发生变