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Nucleic Acids Research It covers research on nucleic acids, such as DNA and RNA, and related work an open access license biological databases biological web servers Cold Spring Harbor Laboratory 是一个非盈利的私人科学研究与教育中心，位于美国纽约州长岛上的冷泉港 癌症 神经生物学 植物遗传学 基因组学 生物资讯学 主要成就为分子生物学领域 Cold Spring Harbor Laboratory Press CSHL Press publishes monographs(专著), technical manuals, handbooks, review volumes, conference proceedings(会议录), scholarly journals and videotapes molecular biology (分子生物学) Genetics(遗传学) Development(发育学) Virology(病毒学) Neurobiology(神经生物学) Immunology(免疫学) cancer biology(癌症生物学) CSH Protocols 9.402 Genes Development 13.623? Genome Research 13.608 Learning Memory 4.219 Perspectives in Biology 9.402 Perspectives in Medicine 1.342 RNA 5.095 Genome Research genome structure function comparative genomics molecular evolution genome-scale quantitative population genetics ClustalW-Multiple Sequence Alignment alignment program for DNA or proteins 常用miRNA基因组数据库 miRBase: miRNA 序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库，是存储miRNA 信息最主要的公共数据库之一 miRGen2.0: miRNA基因组及调控数据 miRNAMap: miRNA基因组图谱和miRNA的靶基因 PMRD:植物miRNA数据库 miRGen2.0 miRNAMap Ensembl数据库 Ensembl是一项生物信息学研究计划，旨在开发一种能够对真核生物基因组进行自动诠释并加以维护的软件。 该计划由英国Sanger研究所Wellcome基金会及欧洲分子生物学实验室所属分部欧洲生物信息学研究所共同协作运营 基因注释的数据来源 基因组数据 UniProt蛋白质序列 NCBI RefSeq蛋白质和核酸序列 EMBL cDNA序列 Gene Ontology 基因本体联合会(Gene Onotology Consortium)所建立的数据库. 旨在建立一套适用于各种物种的，对基因和蛋白质功能进行限定和描述的，并能随着研究不断深入而更新的语义(terms)词汇标准。 这个项目最初是由1988年对三个模式生物数据库的整合开始: (1)果蝇数据库 (2)酵母基因组数据库 (3)小鼠基因组数据库 目前，GO已包含数十个动物、植物、微生物的数据库。 GO语义的分类 分子功能(Molecular Function) 描述在个体分子生物学上的活性，如催化活性或结合活性 生物学过程(Biological Process) 由分子功能有序地组成的，具有多个步骤的一个过程 细胞组件(Cellular Component) 指基因产物位于何种细胞器或基因产物组中，即基因产物在什么地方起作用 模式生物基因组计划 酵母、线虫、果蝇、细菌共约50多种已完成，水稻等70余种正在进行。目前总量已达60亿碱基对！ Escherichia coli大肠杆菌 Saccharomyces cerevisiae酿酒酵母 秀丽线虫Caenorhabditis elegans一种透明的、生活在海滩泥沙中的小虫。 Drosophila melanogaster果蝇 Arabidopsis thaliana拟南芥 PDB数据库 1.简介 美国Brookhaven实验室1971年建立的大分子结构数据库PDB 蛋白质晶体结构