脂肪酸甲酯谱图分析方法 - yzxzcom.doc

脂肪酸甲酯谱图分析方法及其在微生物学领域的应用( 王秋红1,2，蓝江林1、朱育菁1、肖荣凤1，葛慈斌1，林营志1，陈亮2，刘波1*福建省农业科学院生物技术研究所，福州 350003厦门大学生命科学院，厦门 36）脂肪酸Fatty Acid Methyl Ester, FAME）是鉴于脂肪酸可作为生物标记物而发展起来的分析技术。本文介绍了FAME谱图分析方法及其在微生物学领域的应用，包括在微生物检测、鉴定和微生物多样性研究中的应用。 关键词：FAME谱图分析；GC/GC-MS；微生物鉴定；微生物多样性 中图分类号： 文献标识码：AFatty Acid Methyl Ester Fingerprint Analysis and its Applications in Microbial study WANG Qiu-hong1.2, LAN Jiang-lin1, ZHU Yu-jing1, XIAO Rong-feng1, GE Ci-bin1, LIN Ying-zhi1, CHEN Liang2, LIU Bo1* (1. Institute of Biotechology, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350003, China; 2. School of Life Sciences, Xianmen University, Xiamen 361005, China) Abstract: Fatty acid is one kind important biomarker and its application in biology research has been becoming more and more prominent. The elements of FAME fingerprint analysis is that fatty acid can be a biomarker. The paper presents FAME fingerprint analysis and its application in microbial study, including the identification of unknown microbes and the assessment of microbial diversity. Key words: FAME fingerprint analysis; GC/GC-MS; microbial identification; microbial diversity 脂肪酸是生物体内不可缺少的能量和营养物质，是生物体的基本结构成分之一，在细胞中绝大部分脂肪酸以结合形式存在，构成具有重要生理功能的脂类，它是构成生物膜的重要物质；是机体代谢所需燃料的贮存形式；作为细胞表面物质与细胞识别、种族特异性和细胞免疫等密切[1,2]；具有结构多样性和高的生物学特异性，是特别有效的生物标记物[3]。目前脂肪酸作为一类重要的生物活性物质，已经引起了国内外同行的相当重视。 脂肪酸甲酯（Fatty Acid Methyl Ester, FAME）谱图分析方法是鉴于脂肪酸可作为生物标记物而发展起来的分析技术。FAME谱图分析方法是在细胞组分水平上研究微生物的重要技术，通过分析微生物细胞膜上磷脂脂肪酸（Phospholipid Fatty Acid, PLFA）的组分来鉴定微生物的种属、分析微生物多样性，是一种简便、可靠的分析方法。由于用于FAME谱图分析的脂肪酸多为磷脂脂肪酸，所以该方法又称为PLFA谱图分析方法。 1 FAME谱图分析的原理与方法 1.1 原理 FAME,不同微生物体内往往具有不同的磷脂脂肪酸组成和含量水平，其含量和结构具有种属特征或与其分类位置密切相关，能够标志某一类或某种特定微生物的存在，是一类最常见的生物标记物[3,4,5]。但是古生菌不能使用FAME谱图进行分析,因为它的极性脂质是以醚而不是酯键的形式出现[6]。此外,磷脂不能作为细胞的贮存物质,一旦生物细胞死亡，其中的磷脂化合物就会马上消失,因此，磷脂脂肪酸可以代表微生物群落中“存活”的那部分群体[7]。 1.2 方法 FAMEFAME谱图（图1）。根据谱图中脂肪酸甲酯的多样性，利用相关的数据库和相关的计算机分析软件，便可鉴定出样品中微生物的种类或得到样品中微生物群落结构组成多样性、比例以及微生物生物量等方面的信息。对于该研究，主要是通过气相色谱（Gas Chromatography, GC），以及气相色谱-质谱（Gas Chromatography-Mass Spectrum, GC-MS）联用实现的，由于脂肪酸