第十一章 微生物分类及鉴定 重点与难点剖析 一 分类学基础 分类学 .doc

第十一章 微生物分类及鉴定 重点与难点剖析 一. 分类学基础 分类学(taxonomy)：生物分类的科学 微生物分类学(microbial taxonomy):研究微生物分类理论和技术方法的学科 1. M分类学三个组成部分(既独立又相互关联的三个部分): 分类(classification) 鉴定(identification或determination) 命名(nomenclature) 分类(classification)：根据相似性或相关性(进化亲缘关系)将生物归属为类群或分类单元. 鉴定(identification或determination)：决定某一特定分离物归属于某一已确定分类单元的过程。 命名(nomenclature)：给予分类类群单元与公布规则相符的名称. 2. 分类单元及其等级 分类单元(taxon,复数taxa)：是指具体的分类群，如： 原核生物界(Procaryotae)、杆菌科(Enterobacteriaceae)、 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)等都分别代表一个分类单元。 国际公认的7个生物分类单元:界(亚界 ), 门 (亚门 ), 纲(亚纲 ), 目(亚目 ), 科(亚科 ), 属(亚属 ), 种(亚种 ). 除此之外, 在M的分类中, 还常使用一些非正式的类群术语, 亚种以下常用培养物、菌株、居群和型；种以上常使用群、组、系等类群名称 ；近年伍斯 还在界之上使用域(domain)，他把全部生物分为古生菌域、细菌域和真核生物域，域下面再 分界，把域作为分类单元的最高等级。 (1). 种(species): 物种，生物分类中基本的分类单元和分类等 级。 高等生物中，物种通常被看作是彼此杂交能繁殖的自然群体，这个群体与其他群体在生殖上是隔离的。在这里，“生殖隔离”被看作是区分物种的标准。 微生物的种：菌株的一个集合，这批菌株有许多共同稳定特征，并与其他类菌株有显著区别。 有相似G+C组成，DNA杂交同源性在70%以上的菌株的集合。 (2). 亚种(subspecies): 是正式分类单元中地位最低的分类等级。 当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传性状而又不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元--亚种。 变种是亚种的同义词。在《国际细菌命名法规》(1976年修订本)发表以前，变种是种的亚等级，因变种一词易引起词义上的混淆，1976年后，细菌种的亚等级一律采用亚种，不再使用变种。 (3). 属(genus): 介于种(或亚种)与科之间分类等级，也是生物分类中的基本分类单元。通常是把具有某些共同特征或密切相关的种归为一个高一级的分类单元，称之属。 (4). 科(family): 系统分类中，把具有某些共同特征或相关的属归为更高一级的分类单元称为科。 (5). 培养物(culture)：一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。 纯培养(pure culture): 单一微生物细胞繁殖产生的培养物. (6). 菌株(strain)：在一个特定分类学中至少与其他一些群体是可以区别的生物群体。是来自单个或纯培养物的微生物，一个种内菌株间在许多方面有小差别。 (7). 居群(population)：population一词也有人译为群体、种群或群丛等，是指一定空间中 同种个体的组合。 (8). 型(form或type)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状存在差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 由于type一词既代表型又可代表模式 ，为避免混淆，现在对表示型的词作了修改，用var代替type。现将较常用的 型的含义及其表达方式列于表中。 中文译名 推荐使用的名称 以前使用的同义词 应用于只有下列性状的菌株 生物型 biovar biotype 特殊的生理生化性状 血清型 serovar serotype 不同的抗原特征 致病型 pathovar pathotype 对宿主致病性的差异 噬菌型 phagovar phagotype lysotype 对噬菌体溶解反应的差异 形态型 morphovar phagotype lysotype 特殊的形态学特征 常用型的术语及其含义 p322 (9). 群(group), 组(section), 系(series):这些类群名称用在不同场合，常常有非常不同的含义，可以是种水平上的类群，也可以代表属以上等级的分类 单元的集合。如《伯杰氏系统细菌学手册》第一版中，主要根据表型特征将全部原核生物分为33组。将假单胞菌属(Pseudomonas)内的90个种分为5组。 3.微生物的命名 (1). 命名