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水稻抗旱数量性状位点（QTLs）的基因挖掘分析
摘要
|
／水稻是世界上最主要的粮食作物之一，T旱同其他环境胁迫一样．是影响作
一
、。，p一
物产量的重要制约冈素。7水稻的抗旱性?状是由多基因控制的数量性状．只前对抗
／j■■E；：。。一
早性状的遗传改良主要集中在对抗旱数量基冈位点的研究，通过小同的生理机理
或在小同的环境条件下多基冈的祟加效麻来表现抗旱性。
为了寻找抗旱数量性状位点的潜在基冈，我们选用Azucena和1R64的重组近
交系，分别对产量性状和在胁迫与非胁迫的环境条件下进行大田实验。研究表明．
这个群体的分离主要是由于在半矮杆基冈(sdl)两侧区域的等位基冈的变异0f起，
同时这个区段也是引起产量变异的重要位点。
为了对这一区段进行进一步的研究，我们发展了一个生物信息学的程序
(IRlSNP)，利用公布的两套水稻基冈组序列一国际水稻基冈组测序中心测序的
比对来寻找基冈中的SNPs。奉沦文以水稻半矮杆基冈区域的候选基冈为例，详
细描述了建立IRISNP数据库、SNPs发现的程序、互联酬查询界面和SNPs搜寻结
果输出的整个过程。
／
／研究结果表明，有175个基冈位于1号染色体上半矮杆基冈两侧的区域
冈，23为伪基冈，24个未知功能的蛋白但有表达序列标签(EST)匹配的基冈，80
个为假蛋白的基因。另外，在已知功能的基因中深入研究发现有161-基冈与抗旱
、
有紧密相关。人足／＼
关键词：水稻基因组；基冈挖掘：单核苷酸多态性；候选基冈，
Abstract
for of
Riceisan food millions Drought，like
importantstaple peopleglobally
otherenvironmental for
stresses，limits improvement
yield．Genetic
many crop
natureofthe
inricemustdealwiththe trait，
stresstolerance quantitative
drought
theadditiveeffectsofseveral loci the
whichreflects geneticthroughoutgenome．each
the a ot’
a modestcontributiontowards variety
making phenotype，through
in environments
different
conditionally
mechanisms，perhaps
physiological
facilitatethe ofthecandidaterice
To discovery
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