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项目名称： XXXX 转录组结题报告 委托单位： XXXX 制定日期： 2016 年 6 月 27 日 0 目录 I 项目概况 I II 样品提取及文库构建 II III 分析流程III IV 分析项目 IV 1 测序策略 1 2 原始数据整理、过滤及质量评估 3 2.1 数据整理 6 2.2 数据质控 7 2.2.1 碱基质量分布 7 2.2.2 Base content 分布 8 2.2.3 GC content 分布 9 2.2.4 Sequence base quality 10 2.3 高质量序列获取11 3 参考基因组信息整理及统计 12 3.1 参考基因组基本信息统计 12 3.2 参考基因组基因功能注释整理 16 4 Reads 比对分析 18 4.1 Reads 比对基本结果统计 19 4.2 Reads 比对分布区域统计 21 4.3 Reads 比对结果质控 23 5 基因表达量分析 24