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- 2017-09-09 发布于湖北
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02-核酸序列相似性分析
tblastx Click here tblastx: 把核酸序列翻译成蛋白质序列后检索核酸序列数据库 (查询序列和数据库序列都以所有6种读码框翻译后再进行比较) Basic BLAST blastn: 用核酸序列检索核酸序列数据库 blastp: 用蛋白质序列检索蛋白质序列数据库 blastx: 把核酸序列翻译成蛋白质序列后检索蛋白质序列数据库 (查询序列以所有6种读码框翻译后再进行比较) tblastn: 用蛋白质序列检索核酸序列数据库 (数据库中的核酸序列以所有6种读码框翻译后与查询序列比较) tblastx: 把核酸序列翻译成蛋白质序列后检索核酸序列数据库 (查询序列和数据库序列都以所有6种读码框翻译后再进行比较) 6种读码框 5 - TCT TCC TCA AAA TAA AGA AGT ATG GTA ATC - 3 Frame +1 TCT TCC TCA AAA TAA AGA AGT ATG GTA ATC Frame +2 T CTT CCT CAA AAT AAA GAA GTA TGG TAA TC Frame +3 TC TTC CTC AAA ATA AAG AAG TAT GGT AAT C Frame -1 GAT TAC CAT ACT TCT TTA TTT TGA GGA AGA Fr
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