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6课 PubMed生物医学数据库 内容见教材4章1节（P59） 目的与要求： 了解PubMed的特点，掌握使用该数据库进行课题检索的基本途径与方法。本课内容安排有实习，要求掌握检索途径与方法。 教学重、难点： 利用PubMed可检索哪些数据资源。 自动词语匹配转换功能； 主题词/副主题词检索； 五种检索辅助工具的特点及使用。 教学内容： 6.1 Pubmed简介 6.2 通过PubMed可检索到的信息 6.3 PubMed检索界面的结构 6.4 PubMed的检索 6.5 检索结果显示及下载 6.6 My NCBI 6.1 PubMed简介 PUBMED是美国国立图书馆（NLM）所属国家生物技术信息中心（NCBI）建立的生物医学文献检索系统（1997年免费开放），是NCBI开发的Entrez检索系统重要组成部分。 IM MEDLINE PubMed (手工检索) (联机检索、光盘检索) (网络检索) 特点：信息资源丰富、质量高、更新及时、检索方式灵活多样、链接功能强大、使用免费等。 6.2 通过PubMed可检索信息 6.2.1 Medline 6.2.2 PreMedline 6.2.3 出版商提供的书目信息 6.2.4 NCBI其它数据库的相关记录 6.2.1 MEDLINE： 美国国立医学图书馆MEDLARS系统中最大的生物医学数据库。 收录1966年以来70多个国家近4800种生物医学期刊的书目信息和著者文摘，每周更新。 每条记录均带有[PubMed--Indexed for MEDLINE]标志。 6.2.2 PreMedline 未正式给予MeSH词、出版类型等深度标引信息的一个前期临时库，可检索。 “PubMed计划”：出版商在期刊出版之前或同时，将期刊论文题录提供给PubMed，每天NLM把最新记录加入到PreMedline库。 工作人员一周内将这些记录标引，然后转入MEDLINE，同时从PreMedline中删去。 带有[PubMed--in Process]标志。 6.2.3 出版商提供的书目信息： 出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分没有被MEDLINE收录，PubMed仍保存，在记录中做[PubMed--as supplied by publisher]的标记。 出版商提供的记录若有全文，PubMed则建立了与此期刊节点的链接，可免费或交一定的费用直接联机获取原文 。 6.2.4 NCBI其它数据库的相关记录： PubMed建立了与NCBI其他数据库之间联系，通过Medline记录链接获取相关的基因库记录，也可以通过基因库记录链接获取相关的Medline记录。 NCBI数据库 PubMed：在主页上提供与NCBI的7个数据库建立了超链接： Nucleotide：DNA序列数据库。 Protein：氨基酸（蛋白质）序列数据库。 Genome：基因组序列数据库，提供所有基因与染色体纪录与图片的查询服务，这个库中数以百万的基因序列是由庞大的基因排序工作得来的。 Structure：分子结构模型数据库，这个数据库保存的是由X线晶体成像、NMR分光光度法建立的三维分子结构。 Popset：种群、种系发生或突变序列数据库，是由相关种族、人类发展、突变研究得来的人类进化与人种差异的结果。Taxonomy：生物分类数据库 OMIM：人类孟德尔遗传学联机数据库。 Books：相关图书，可链接到相关参考书籍的文摘页。 All Database跨库检索 PUBMED进入方式 /pubmed 或用搜索引擎搜“PubMed”地址。 6.3 PubMed检索界面的结构 6.4 PubMed的检索 6.4.1 基本检索 6.4.2 PubMed检索辅助工具 Limits （限定功能） Preview/Index（预览/索引） History（检索史） Clipboard（剪贴板或文件夹） Details（明细栏） 6.4.3 主题词/副主题词检索 6.4.4 其他检索 6.4.1 基本检索 一. 词语检索* 二. 期刊检索 三. 作者检索 四. 截词检索 强制短语检索 PubMed首先将键入的检索词（如： diabetes mellitus ）视为合理的短语在短语索引中进行查找，并自动把两个词分开以“逻辑与”组配检索。 如不希望系统将两词分开： 增加了关系不大的文献（如“gastric cancer” ） 分开后意义有变化（如 “single cell” ） 用“”进行强制词组检索。如 “single cell”、 “gast