正交信号校正在正常成人血清1H NMR谱的代谢组分析中的滤噪作用评价.pdfVIP

2007 年第 65 卷 化 学 学 报 Vol. 65, 2007 第 2 期, 152～158 ACTA CHIMICA SINICA No. 2, 152～158 ·研究论文· 正交信号校正在正常成人血清 1H NMR 谱的代谢组分析中的滤噪作用 评价 冒海蕾a,c 徐 旻 b 王 斌 c 王惠民 c 邓小明*,a 林东海*,b a ( 第二军医大学长海医院 上海 200433) (b 中国科学院上海药物研究所 上海 201203) (c 南通大学附属医院 南通 226001) 摘要 观察、比较正交信号校正(OSC)滤噪前后, 用不同的模式识别方法对正常成人血清代谢组 1H NMR 谱进行分析的 效果, 以探讨 NMR 代谢组学技术应用于临床研究和疾病早期诊断的可行性. 78 例正常成人在采血前按常规要求禁食 8 h, 记录血清一维 600 MHz 氢谱后, 分别采用主成分分析(PCA)、偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA) 以及簇类的独立软 模式法(SIMCA)对氢谱进行模式识别分析. 结果表明: 虽然采血前并无其它诸如饮食、生活方式、生理周期等方面的严 格限制, 采用 OSC 滤噪后, PLS-DA 能够完全区分不同性别的血清氢谱, 其判别能力优于 PCA 和 SIMCA. 而且采用 OSC 滤噪与文献报道的未经 OSC 处理的 PLS-DA 法获得的与性别分类有关的主要 NMR 积分区段基本相同. 从 OSC 去除不同数目的隐变量后所致的 PLS-DA 模型的性能改变可见: OSC 去除两个隐变量时, 前两个隐变量的特征值明显 比后面的大; 剩余残差为 20.82%, 即去除了 79.18% 的X 变量中与反应变量 Y 不相关的系统变异. 此时 PLS-DA 计算所 得的隐变量个数为 1; 而不使用 OSC 或用 OSC 去除一个隐变量时, PLS-DA 所得的隐变量个数分别为 3 和 2. 作为 PLS-DA 模型质量的评价指标, R2X 表示 PLS-DA 模型计算所获得的隐变量反映自变量 X 的变异的百分比, R2Y 则表示 隐变量反映因变量 Y 的变异的百分比, Q2 (cum)为交叉验证后 PLS-DA 模型所获隐变量能够预测 X 和 Y 变异的累计百 分比. R2X 在 OSC 去除两个隐变量时达到最低值, 表明此时 PLS-DA 计算模型包含的系统变异最少; R2Y 与 Q2 (cum) 都达到 80% 以上并趋于稳定, 说明 OSC 去除两个隐变量时 PLS-DA 模型的质量优良. 显然, OSC 可去除饮食、环境等 因素的影响, 降低临床样本的不均一性, 这对于 NMR 代谢组学技术应用于临床研究至关重要. OSC 滤噪去除的隐变量 个数应根据剩余残差、去除隐变量的特征值大小、PLS-DA 模型计算所得的隐变量个数和反映模型质量的相关指标加 以判断. 关键词 NMR; 代谢组学; 模式识别; 正交信号校正; 血清 Evaluatio