一个内含子长度多态性标记与栽培稻F1花粉育性基因座连锁.pdfVIP

分子植物育种，2006 年，第 4 卷 ，第 3 期，第 323!328 页 Molecular Plant Breeding, 2006, Vol.4, No.3, 323!328 研究报告 Research Report 一个 内含子长度多态性标记与栽培稻 F1 花粉育性基 因座连锁 吴海滨 1,2 朱汝财 1 李迪 1 赵德刚 2* 白羊年 1* 1 海南省热带农业资源开发利用研究所, 三亚, 572025; 2 贵州省农业生物工程重点实验室, 贵州大学, 贵阳, 550025 * 共 同通讯作者, degangzhao@; baiyangnian@ 摘 要 本研究利用两份栽培稻(Oryza satioa L.)种质 HITAR005 和 IRGC20509 杂交建立 了含有 500 个单 株 的 F2 群体，采用 内含子长度多态性标记对 F2 群体中的 117 株进行 了标记基 因型分析 。 研究发现一个 内含 子长度多态性标记 ，RI0 1594 ，其标记座位上与父本(IRGC20509)相 同基 因型的纯合植株完全消失，且母本纯 合基 因型植株与杂合基 因型植株 的比率符合 1:1(!2C=0.90, 2CX20.05) ，表现 出一种 明显的偏分离现象 。 分析该 分子标记所在 的 目的序列， RI01954 标记所位于的基 因含有 3 个 内含子是一个功能未知的转录 因子 ， 粳稻 Nipponbare ( 日本晴)在该基 因的第 3 个 内含子序列与舢稻 9311 的序列相 比有 24 个碱基 的缺失。 进一步分 析 RI01954 标记 的 PCR 产物表 明，发现消失的纯合植株基 因型偏 向于粳稻 Nipponbare ( 日本晴) 。 结合供试 的 F2 群体的花粉育性检测结果，初步表 明 RI01594 标记与栽培稻 F1 花粉育性基 因座连锁 ，与 F1 花粉不育基 因座连锁 的遗传距离小于 0.5cM ，推测与 RI01954 标记连锁 的栽培稻的 F1 花粉不育性基 因座是一个新 的杂 种不育位点。 关键词 栽培稻, 内含子长度多态性, F1 花粉育性, 偏分离 An ILP Mar ker Close Linking with the Tentative Novel F Pollen Sterile 1 Locus in Cultiv ated Rice 1,2 1 1 2* 1* Wu Haibin Zhu Rucai Li Di Zhao Degang Bai Yangnian 1 Hainan Institute of Tropical Agricultural Resources, Sanya, 572025; 2 Guizhou Key Laboratory of Agricultural Bioengineering, Guizhou University, Guiyang, 550025 * Co-corresponding author, degangzhao@; baiyangnian@ Abstract The F population containing 500 individuals was developed using two cultivated rice germplasms (O! 2 ryza satioa L.), HITAR005 as female parent from HITAR and IRGC20509 as male parent from IRRI, and the ILP (intron length polymorphism) markers were employed to genotype the 117 individuals of the F2 population. RI01954, an ILP marker mapped in the 3rd chromosome, w