比较蛋白质组学及其在辐射损伤生物效应研究中的应用 comparative proteomics and its application in radiation injury investigation.pdfVIP

第27卷第3期(总第159期) 辐射防护通讯 2007年6月 ·综 述· 比较蛋白质组学及其在辐射损伤生物效应研究中的应用 王放。 王仲文2 左雅慧1 摘要比较蛋白质组学是蛋白质组学的主要研究内容之一，近年来已应用到辐射损伤生物效应领域。本文介绍 了比较蛋白质组学的基本概念．适用于比较蛋白质组学研究的几种主要方法及其优缺点．以及在辐射损伤生物效应 研究领域中的应用。 关键词：蛋自质组学比较蛋白质组学辐射损伤效应 中图分类号：R818．74 文献标识码：A 文章编号：lO呻6356(2007)03—0023．04 l引言 质组学“完整”的数据库和实现网络资源共享的条 蛋白质组是指某种细胞、组织或生物体的基 件尚未成熟。 因组在特定的时间和空间上所表达的全部蛋白质 (2)比较蛋白质组学的研究。 及其存在方式。蛋白质组学是以蛋白质组为研究 比较蛋白质组学可用来研究寻找和筛选引起 对象，研究生物系统内特定时间或特定条件下蛋 样本之间差异蛋白质谱的影响因素，揭示细胞生 白质表达规律的科学…。 理和病理状态的进程与本质、对外界环境刺激的 蛋白质组学研究内容主要有”1：①组成性蛋 反应途径以及细胞调控机制，同时获得对某些关 白质组学，即对某个体系的蛋白质进行鉴定并详 键蛋白质的定性和功能分析，揭示一定的生物学 细阐述其翻译后修饰的特性；②差异显示蛋白质 现象和规律”o。 组学，即比较蛋白质组学，比较生物体在不同时刻 比较蛋白质组学的研究不需要捕获全部蛋白 或不同状态下蛋白质表达的变化；③相互作用蛋 质，重在找出有意义的差异蛋白质，因而有很高的 白质组学，通过各种先进技术研究蛋白质之间的 可实现性。 相互作用，绘制某个体系的蛋白质作用的网络图 谱。 2比较蛋白质组学的研究方法 蛋白质组学的研究途径有两条： 双向聚丙烯酰胺凝胶电泳(2一DE)、同位素标 (1)建立蛋白质组学数据库。 记亲和标签技术(IcAT)、表面增强激光解吸离子 像基因组学的研究一样，力图“查清”人类大 飞行时间质谱技术(SEⅢr)和生物信息学技术是 约三万到四万多基因编码的所有蛋白质，建立蛋 适用于比较蛋白质组学研究的几种主要方法。 白质组学数据库。 2．1双向聚丙烯酰胺凝胶电泳 蛋白质组具有动态性、多样性、时闯性、空间 双向聚丙烯酰胺凝胶电泳2．DE)出现于 性和特异性等特性，在不同的组织细胞中蛋白质 1975年”J，是比较蛋白质组学研究的重要手段之 合成及表达的种类、数量和修饰状态有很大的差 一。其基本原理是电泳第一相为等电聚焦，根据 异。随着对蛋白质组学的深入理解和具体工作的 蛋白质的等电点(p，)不同而分离；电泳第二相为 开展，人们逐渐认识到，在短时间内建立人类蛋白 sDS—PAGE，是根据蛋白质相对分子质量的差异来 收稿日期：2007．03．24 作者简介：王放(197l一)男，2∞3年毕业于长治医学院医学影像专业，中国辐射防护研究院放射医学专业硕士在 读。 一23～ 万方数据万方数据 辐射防护通讯2007年6月第玎卷第3期 进一步分离蛋白质混合物。目前已可分离到 重复性好，敏感性高，价格低廉，便于自动化，可以 1 000～3 000个蛋白质样