基于Q-TOF的代谢组学分析在青枯菌致病性研究中的应用 - yzxzcom.DOC

青枯雷尔氏菌致病性的代谢组学异质性研究 史怀，刘波*，陈峥，郑雪芳，潘志针，陈梅春，朱育菁 福建省农业科学院农业生物资源研究所摘要：12种代谢标志物与强致病力菌株具有显著性差异≥2），并表现出相同的丰度变化趋势，这些代谢标志物可能与青枯雷尔氏菌的致病性有关。关键词：代谢组学，青枯雷尔氏菌，致病性 Metabonomic heterogeneity analysis for Pathogenicity of Ralstonia solanacearum ShiHuai, LiuBo, ChenZheng, ZhengXuefang, PanZhizhen, Chen Meichun, Zhu Yujing Agricultural Bioresources Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou, 350003, China Abstract: The metabolites of Ralstonia solanacearum with various pathogenic were analysed by metabonomic method based on LC/Q-TOF MS. Significant metabolic markers were used for classification pathogenic of Ralstonia solanacearum by PCA analysis, and PLS-DA prediction model were established. The result showed metabonomic analysis could be used for indentify virulent Ralstonia solanacearum strain and avirulent strain and Tn-5 mutant strains. There were 12 metabolites showed similar trend and had significant differences between virulent strain and avirulent strains (both wide-type and Tn-5 mutant), it showed these 12 metabolites were probably related to the pathogincity of Ralstonia solanacearum. Key Words: metabonomic, Ralstonia solanacearum, Pathogenicity 青枯病是由青枯雷尔氏菌（Ralstonia solanacearum）引起的一种世界范围的重要土传病害，可危害包括许多重要经济作物在内的44个科的300多种植物，此外还可侵染多种杂草和其他非寄主植物的根部。多数作物一旦发病即表现枯萎症状并导致全株死亡，每年造成巨大的农业经济损失[1]。青枯雷尔氏菌存在强致病性菌株和无致病性菌株，前者侵染寄主植物后可导致寄主的发病；后者可以侵染寄主植物，但不引起寄主发病[2]。在自然状态下，青枯雷尔氏菌致病力具有多样性，菌株混杂。青枯雷尔氏菌致病力的早期快速检测，对于预测青枯雷尔氏菌的发生危害，研究其微生态关系具有重要意义。目前，青枯雷尔氏菌致病性的测定方法有：生物测定、选择性培养基测定、脂肪酸测定、离子交换色谱测定、蛋白组学测定等[3-6]。 代谢组学（metabonomics）通过定性定量测量生物体代谢产物的种类和浓度变化，分析系列关联生物标记物的综合差异，从而揭示生物系统对基因以及环境变化的应答[7]。微生物的代谢产物在其生长稳定期相对稳定且产量高；同时，微生物的培养条件、样品制备以及代谢组学数据采集方法均人为可控，实验数据具有可重复性。已有研究将代谢组学分析用于微生物的分类鉴定[8-11]，但不同致病性青枯雷尔氏菌的代谢组学分析与判断尚未见报道。 本研究采用基于LC/Q-TOF MS的代谢组学分析方法，考察不同致病性青枯雷尔氏菌菌株胞外代谢物的异质性，并初步建立青枯雷尔氏菌致病性的代谢组学判别模型。 1材料与方法 1.1 供试菌株 青枯雷尔氏菌（Ralstonia solanacearum）强致病力菌株（）、无致病力菌株（）以及强致病力菌株经Tn-5转座子随机插入导致致病力丧失的菌株（人工致弱，以下简称Tn-5致弱菌株），均为本课题组自行分离保存，其信息见表1。 表1 供试菌株 Table 1 Strains for experiment 菌株编号 致病