番茄P6与 部分来源多糖裂解酶家族I的 5.pdfVIP

武汉植物学研究2007，25(3)：282—288 , ／ourmd D，WuhanBotanicalResearch 番茄 P56和部分来源多糖裂解酶家族 I的 其它蛋 白的系统演化分析 赵庆新 ，张宇玲 (1．江苏省滩涂生物资源与环境保护重点建设实验室，盐城师范学院生命科学与技术学院，江苏盐城 224002； 2．江苏省生物多样性和生物技术重点实验室，南京师范大学生命科学学院微生物技术实验室，南京 210097) 摘 要：果胶裂解酶包含果胶酸裂解酶 (pectatelyase)和果胶酸酯裂解酶 (pectinlyase)二种形式 ，是一类多糖裂解 酶，由细菌、真菌、植物和线虫等生物产生，分布在 5个多糖裂解酶家族，果胶酶在食品与饮料、纺织与洗涤、制药等 工业中有广泛的应用。利用 NCBIBLASTX服务器，搜索与番茄 I：56蛋白氨基酸序列相似且都属于多糖裂解酶家 族 I的果胶裂解酶蛋白序列共28条，用 DNAMAN软件分析其保守区，用CLUSTALX8．0软件进行序列 比对和Bi． oEdit软件进行文件转换 ，进一步用 PUAP4．0软件构建系统进化树。构建的MP树 (phylogenetictrees)和 NJ树 (neighbor-joining)显示：来 自植物的果胶酸裂解酶、真菌的果胶酸酯裂解酶、细菌的果胶酸裂解酶分别可聚为一个 独立的类群；相对于细菌果胶酸裂解酶和真菌果胶酸酯裂解酶而言，构巢 曲霉 (Aspergillusnidulans)的果胶酸裂解 酶A和植物的果胶酸裂解酶之间有较近的亲缘关系；细菌Pseudomonassyringae的果胶酸酯裂解酶和真菌的果胶酸 酯裂解酶之间的亲缘关系较近。 关键词：果胶酸裂解酶 ；果胶酸酯裂解酶；多糖裂解酶家族 I；系统演化树 中图分类号：Q55 文献标识码 ：A 文章编号：1000．470X(2007)03．0282．07 PhylogeneticAnalysisofTomatoP56andSomeOtherProteins from P0lysaccharideLyaseFamliyI ZHAOQing．Xin一．ZHANGYu．Ling (1．JiangsuProvincialKeyLaboratoryofCoastalWetlandBioresourcesandEnvira~temalPro~awn，YanchengTeachersCollege， Yaneheng，Ji蚰孽Iu 224002，China；2．JiangsuKyeLaboratoryfor口 a 琦 amtBiotechnology，Microbail，Technology Laboratory k‘CoU~geoflgeScience，Na ngNorma／Un／vent／‘y，Nanjing 210097，China) Abstract：Pectateandpectinlyasesareaclassofpolysaccharidelyasesproducedbyadiversegroup of orgnaismsincludingbacteria，fungi，plnatnadnematodes．Variouspectatelyasesnadpectinlyasesaredi— videdintofivefamilies．ByNCBIBLASTX server，tomatoP56ma ino—acid sequencewascompraedwith ohterpecattenadpectinlyasesbelongingtopolysaccharidelyasefma ily I28proteins，withhigheridentity ofma inoacidsequencecomparedtoP56ma ino—acidsequence，wereobtained．Onhtebaseofthecon— structingphylog