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论文题目：功能基因组的复杂逻辑网络及其应用研究 一、立论依据（选题的研究意义、国内外研究现状分析） LAPP与通常的机理建模方法不同，它是一种从元素的表达数据出发，通过一系列有效的逻辑分析，发现元素之间的逻辑关联性的方法。 这就使得通过数据分析建立逻辑性的机理模型成为可能。 在生物学中，随着研究的不断深入，研究者已经不满足于揭示元素（蛋白质、基因）之间简单的相关性，还希望知道两个（或多个）元素之间具有“怎样”的相关性。 LAPP方法可以揭示这些元素之间更深入的关系，即逻辑关系，而LAPP方法能够批量地发现这类逻辑关系。 这种方法可以帮助生物医学研究者了解一些未知蛋白或基因之间的可能的逻辑功能，从而通过实验发现它们之间新的生物学机理。 开题报告实例（资料来自网络） * 论文题目：功能基因组的复杂逻辑网络及其应用研究 一、立论依据（选题的研究意义、国内外研究现状分析） 自Bowers的开创性工作后的几年来，这个方法在理论、算法和应用上都有了新的发展。 （以下是解决问题的新进展） 发现的逻辑关系很自然地从一阶、二阶发展到三阶和更高阶的逻辑； 并且一些作者还提出新型逻辑：一个原因多个结果的逻辑类型和与取值有关的逻辑类型； 除了U值算法可以发现元素之间的逻辑关系之外，还有贝叶斯方法等概率算法和数据挖掘算法，用于发现数据中的逻辑关系。 （以下是解决问题后的新应用） 开题报告实例（资料来自网络） * 论文题目：功能基因组的复杂逻辑网络及其应用研究 一、立论依据（选题的研究意义、国内外研究现状分析） 在应用方面，逻辑分析不仅应用在系统发生谱数据上（离散数据）去揭示未知蛋白的功能， 还应用在肿瘤的基因表达数据上分析致病机理，给临床治疗提出建议， 甚至结合其他形式的数据一起分析各种类蛋白之间的关系。 （以下是阐述LAPP存在的不足，同时引出加以研究的可行） 同时，LAPP方法也有其缺陷和困难之处，在应用方面也远没有推广。 因此，LAPP方法无论在理论、算法和应用上都具有广阔的发展空间。 （以下是作者对这个问题研究、发展的思想） 开题报告实例（资料来自网络） * 论文题目：功能基因组的复杂逻辑网络及其应用研究 一、立论依据（选题的研究意义、国内外研究现状分析） 复杂系统是当今科学与工程研究中最常见的对象 在系统中，元素之间和子集之间具有一定关联性 这些关系及其全体的组合成为系统的结构。 用连线、箭头或者加权的边表示，其整体构成网络图（无向、有向、加权等等）， 因此，复杂系统对应着复杂网络。 生物学家经常利用大规模网络来研究复杂的生物学现象，例如生物学中的各种系统（血液、内分泌、解剖、功能基因等）。 开题报告实例（资料来自网络） * 论文题目：功能基因组的复杂逻辑网络及其应用研究 一、立论依据（选题的研究意义、国内外研究现状分析） 更有意义的是，用LAPP方法揭示复杂网络中元素（部件）之间的因果关系或制约关系之后，启发人们对网络的调控发展出更多更有效的方法。 在研究和揭示生物学现象的复杂性和规律性中，这种系统的方法显然有相当的价值。 因此，LAPP方法也是生成复杂逻辑网络的一个重要方法，可以用于其他领域的复杂系统的研究 将LAPP方法应用到构建复杂功能基因组网络中，并对基因网络进行结构分析与调控。 目前通过文献检索并未发现有关方面的研究报告。基于此，提出了本文的研究。（从自己思想、调研发现、到可以研究的结论） 开题报告实例（资料来自网络） * 论文题目：功能基因组的复杂逻辑网络及其应用研究 二、研究方案 1．研究目标、研究内容和拟解决的关键问题 ⑴研究目标 使用模拟计算的方法大规模的研究基因表达调控网络， 建立一种分析多元基因非线性逻辑关系和基因表达调控网络模型的方法， 为分子生物学家提供一种细胞分子通路和基因表达网络分析的方法分析手段和参考模型。 （与前述发现可以扩展研究的方面一一对应） 开题报告实例（资料来自网络） * 论文题目：功能基因组的复杂逻辑网络及其应用研究 二、研究方案 1．研究目标、研究内容和拟解决的关键问题 ⑵研究内容 生物体本身是一个复杂系统，网络模型是对复杂系统的高度抽象。本文主要研究生物中的基因网络： 用LAPP方法建立功能基因组（或蛋白）之间的逻辑关系，由此生成功能基因组的高阶逻辑网络， 并对高阶逻辑网络拓扑结构和统计性质进行研究。 把研究结果应用到拟南芥和肿瘤（结肠癌和黑素瘤）基因组上， 对生物反应机制和致病机理进行模拟调控，从而揭示生物学上的一些规律。 （以上要研究解决的具体问题） 开题报告实例（资料来自网络） * 论文题目：功能基因组的复杂逻辑网络及其应用研究 二、研究方案 1．研究目标、研究内容和拟解决的关键问题 ⑶关键问题（以下是对研究问题的深化） 逻辑的存在性和不确定性系数的