蛋白质组学技术在筛选生物标志物方面的应用研究进展 - 南华大学学报.pdfVIP

322 Medical Science Journal of Central South China,May2015,Vol.43,No.3 DOI:10郾15972/ j郾cnki郾43鄄1509/ r郾2015郾03郾025 ·文献综述 · 蛋白质组学技术在筛选生物标志物 方面的应用研究进展 1 2 2 2 1,2,3* 李林蔚 ,丁德馨 ,李广悦 ,胡摇 南 ,易摇 岚 (1.南华大学药学与生物科学学院生物研究所,湖南衡阳421001; 2.南华大学矿业工程博士后科研流动站;3.南华大学铀矿冶生物技术国防重点学科实验室) 摘摇 要:摇 随着蛋白质组学技术的不断发展,蛋白质作为生物标志物在肿瘤的早期诊断以及治疗效果评价等 方面的应用日益广泛。 近年来,蛋白质组学技术在环境污染预警方面的作用也日益受到关注。 本文就几种常用的 蛋白质组学分离分析技术及其在肿瘤相关生物标志物、环境污染预警生物标志物筛选中的应用做一综述。 关键词:摇 蛋白质组学;摇 生物标志物;摇 肿瘤;摇 环境污染 中图分类号:Q81摇 摇 摇 文献标识码:B 摇 摇 生物标志物(biomarker)是指可以标记系统、器 1摇 蛋白质组学技术 官、组织、细胞及亚细胞结构或功能的改变或可能发 生的改变的生化指标,如DNA、RNA、蛋白质、酶、脂 1.1摇 蛋白质组学分离标记技术摇 摇 基于质谱数据 类、糖类、代谢物等都可以作为生物标志物用于研 统计分析的非标记分离方法利用蛋白质分子量和等 究。 生物标志物可应用于疾病的早期诊断和监测治 电点不同来分离蛋白质的双向聚丙烯酰胺凝胶电泳 [1鄄2] 疗效果,发现治疗药物靶位 ;可以阐明各种污染 (2D鄄PAGE)和双向荧光差异凝胶电泳(2D鄄DIGE)。 物的作用机理,确定各种污染物与生物体之间已发 基于和液相色谱—串联质谱(LC鄄MS/ MS)联用的同 生的相互作用;此外,标志物还可以用于流行病学或 位素标记技术利用同位素编码亲和标签(ICAT)、细 毒理学研究,以判断生物是否暴露于某些环境因素 胞培养氨基酸稳定同位素标记(SILAC)或同位素标 中。 筛选出有用的生物标志物不但对疾病的诊断和 [4] 记相对和绝对定量标记(iTRAQ) 等。 治疗有着重大的意义,并可以与生态学效应相联系, 1.2摇 蛋白质组学分析技术 从而制定研究解决环境问题的方案。 以前常用于筛 1.2.1摇 质谱技术(MS)摇 质谱分析是一种测量离子 选生物标志物的方法是基因组学,随着人类基因组 荷质比(电荷—质量比)的分析方法,其基本原理是 测序的完成,人们发现基因的表达方式错综复杂,基 使试样中各组分在离子源中发生电离,生成不同荷质 因组学不能回答人类关于生命活动的许多问题,而 比的带正电荷的离子,经加速电场的作用形成离子束 蛋白质才是基因功能的实施者,了解蛋白质的结构、 进入质量分析器,在质量分析器中,再利用电场和磁 定位和蛋白质间相互作用和蛋白质的功能则明显更 场使发生相反的速度色散,将它们分别聚焦而得到质 有利于了解生命现象的本质,这便是蛋白质组学 谱图,从而确定其质量。 MS是不可或缺的核心蛋白 [3] (proteomics) 。 本文就蛋白质组学在筛选生物标 质组技术,可以高度敏感和高通量鉴定蛋白质或多肽 志物中的研究进展综述如下。