猪瘟病毒e2蛋白序列、结构及其功能分析seqeunce, structure - abc.pdf

猪瘟病毒E2蛋白序列、结构及其功能 分析 Seqeunce, structure and function analysis of CSFV E2 小组：S1G05 组员：岳龙 王素艳蔺俊丽 李婷婷 报告人：李婷婷 主要内容 • 一、研究背景 • 二、E2蛋白的核酸序列分析 • 三、E2蛋白的氨基酸序列分析 • 四、E2蛋白的结构分析 研究背景  猪瘟病毒（CSFV ）是黄病毒科瘟病毒属成 员，瘟病毒属还包括牛病毒性腹泻病毒 （BVDV）和绵羊边界病毒（BDV）。基因 组为单股正链RNA，包含一个大的开放阅读 框，编码四个结构蛋白（C、E0、E1、E2） 和8个非结构蛋白。  E2蛋白是病毒诱导机体产生中和抗体的主 要保护性抗原，因此，研究清楚它的序列 和结构对研制高效疫苗和快速血清学诊断 试剂具有重大意义。 E2蛋白核酸序列分析 从uniprot调取E2蛋白的氨基酸序列，登录号 A7L897 。 E2蛋白核苷酸序列分析 利用cusp程序分析该基因的密码子使用特征 利用remap程序分析酶切位点，有限制性内 切酶Hin4I的2个酶切位点 Dottup分析 E2蛋白氨基酸序列分析 用Weblab 中的氨基酸分析程序pepstats，分析 此蛋白的氨基酸组成 BVDVE2蛋白的氨基酸组成 BDVE2蛋白氨基酸组成 利用CBS网站中的糖基化位点预测程序 NetNGlyc 1.0 Server E2蛋白结构分析 蛋白亲疏水性分析 跨膜区域分析 Weblab Tmap 跨膜分析 SMART 分析 TMHMM分析 瘟病毒属毒株序列比对 MEME分析保守基序 序列比对 谢谢