几种植物类伐昔洛韦水解酶基因的生物信息学分析bioinformatical .pdfVIP

算分子生物学(网络版), 2015 年, 第 4 卷, No.4, 1-10 Jisuan Fenzi Shengwuxue (Online), 2015, Vol.4, No.4, 1-10 究报告 Research Report 几种植物类伐昔洛韦水解酶基因的生物信息学分析 巴德仁贵 , 李爽 , 王绍萌 , 马勇 , 哈斯阿古拉 内蒙古大学生命科学学院/ 内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室, 呼和浩特, 010021 通讯作者, hasind@; 作者 计算分子生物学, 2015 年, 第 4 卷, 第 4 篇 doi: 10.5376/.2015.04.0004 收稿日期: 2015 年04 月28 日 接受日期: 20 15 年04 月28 日 发表日期: 2015 年04 月28 日 2015 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台 本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》印刷版2015 年，第34 卷，第02 期上。现依据版权所有人授权的许可协 ，采用Creative Commons Attribution License,协 对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。 摘 要 以拟南芥和蓖麻为重点，利用生物信息学对不同植物的类伐昔洛韦水解酶(valacyclovir hydrolase-like, VACVase-Like)蛋白的理化性质、保守结构域、信号肽、跨膜结构域、导肽、亲疏水性、二级结构及三级结构等进行预测和 分析，并构建了该家族系统发生树。结果表明，除了可可树属于稳定蛋白外，其余均属于不稳定蛋白。该基因家族均含有明 显的信号肽、导肽、跨膜结构和亲疏水结构，且结构组成上相似，属于分泌蛋白，但是对亚细胞定位分析发现，在不同植物 中存在和发挥功能部位均不相同。分析结果可为植物 VACVase-like 的研究提供有价值的信息，为进一步研究其在植物体内 的功能和作用机理提供依据。 关键词 类伐昔洛韦水解酶；生物信息学；α/β水解酶 Bioinformatical Analysis Of VACVase-Like Gene From Several Plants Bade Rengui , Li shuang , Wang Shaomeng , Ma Yong , Hasi Agula College of Life Sciences, Inner Mongolia University, Inner Mongolia Key Laboratory of Herbage ＆ Endemic Crop Biotechnology, Hohhot, 010021 Corresponding author, hasind@; Authors Abstract Base on the Arabidopsis thaliana and Ricinus communis, The physical/chemical properties, conserved domain, signal peptide, trans-membrane domain, leader peptide, hydrophobicity/hydrophilicity, the secondary and tertiary structure of the proteins were predicted and analyzed for valacyclovir hydrolase-like (VACVase-Like) of several plants by bioinformatics tools, phylogenetic trees were constructed. The results showed that most of these VACVase-Like proteins are structural stable except for Theobro