烹i中ofchr药tese a杂teria 志edica v0l＿39．issu.pdfVIP

第 39卷第 11期 烹 I中ofChr。药tesea杂teraie志dcia VJ0u_ln3e9．Issue11 2014年 6月 ， 2014 三七皂苷类成分的蛋 白质相互作用网络分析 任真真 ，张燕玲 ，王星，王石峰，贺昱延，翟晨曦，乔延江 (北京中医药大学 中药信息工程研究中心，北京 100102) [摘要] 三七皂苷类成分是三七发挥药效的活性部位，目前对其作用机制尚无系统的研究。该文构建了三七皂苷类成 分的蛋白互作网络并对网络进行模块分析，通过模块的功能及包含的蛋白从分子水平上阐释三七皂苷类成分的作用机制。 结果表明三七皂苷发挥药效主要与环磷酸腺苷代谢、血管伸缩、血液凝固、T细胞增殖与分化等生物过程相关。 [关键词] 三七皂苷；蛋白互作网络；功能模块；分子作用机制 三七为 五加科植 物三七 Panaxnotoginseng 皂苷Rb及三七皂苷R。成分对应靶点信息来源于 (Burk．)F．H．Chen的干燥根，主产于广西云南 。现 ChEMBL (https：／／www．ebi．ac．uk／chembl／#)和 代药理研究表 明三七发挥作用主要与抗凝血、扩张 STITCH3．1 (http：／／stitch．emb1．de／)数据库 (截 血管、抗心肌缺血、降血压、抗动脉粥样硬化等药理 止2013年4月)，其中STITCH数据库对每一个成 作用有关 4。。三七 中主要有效成分为人参皂苷 分-靶点关系都有一个打分值，本实验选择打分高于 Rb，人参皂苷Rg及三七皂苷 R，也是含三七注射 0．7的高置信度数据，并对挖掘出的信息逐条检查， 液中的药效成分，目前含三七的注射液主要有三七 去除低质量数据，以确保数据的可靠性。 总皂苷注射液、血塞通注射液及复方丹参注射液等。 1．2 基于药效团搜索的三七皂苷成分作用靶点辨 目前对三七及其注射液分子作用机制的研究较少且 识 药效团是指药物分子与受体结合或作用时起重 不能体现中药对人体的整体调节。网络药理学 J 要作用的原子或基 团组合，与这些原子或基团的空 的研究与中医药的 “整体观”与 “辨证论治”不谋而 间距离限制共 同构成了三维药效团 J。基于药效 合，可通过系统观察药物对生物网络的干预与影响， 团技术的中药有效成分群辨识是指 以三维药效团辨 揭示药物作用于人体的奥秘。本文通过确定人参皂 识模型，利用三维数据库搜索技术，对中药化学成分 苷Rg、人参皂苷Rb及三七皂苷 R作用的靶点，利 数据库进行搜索匹配，辨识出作用于同一靶点具有 用这些靶点及蛋 白质相互作用信息构建三七皂苷类 相似活性的中药有效成分群。 成分作用的蛋 白互作网络。通过对网络进行模块分 本研究基于本实验室 已构建的27个靶点三维 析及模块功能的注释，以期从分子网络水平上阐释 药效团辨识模型，对人参皂苷 Rb、人参皂苷Rg及 三七皂苷类成分的作用机制，为三七及其注射液的 三七皂苷 R进行了辨识 。辨识过程就是用药效团 研究提供科学依据。 辨识模型中可反映靶点活性的药效特征与化学成分 1 材料与方法 进行匹配的过程 。 1．1 数据挖掘 经过文献调研，本研究选取三七 中 1．3 三七皂苷类成分蛋 白互作网络的构建及分析 含量较高且活性较强的3个主要皂苷类成分对其进 蛋 白质相互作用信息来 自于 String9．1数据库 行成分靶点的数据挖掘 ，分别为人参皂苷 Rg、人参 (http：／／string-db．org／) ，String数据库是一个储