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CottonScience
棉花学报 CottonScience2011,23(6):500-一506
棉花品种资源群体结构与连锁不平衡分析
张友昌1,别墅1,易先达1,张成1。李成奇2,秦鸿德卜
(1.湖北省农业科学科院经济作物研究所,武汉430064;2.河南科技学院生命科技学院,新乡453003)
sequencerepeat,SSR),对收集
摘要:用基因组扫描的方法,利用棉花9个连锁群上的79个微卫星标i己(Simple
结果表明:本研究群体可划分为3个群体,其中两个群体分别由3个亚群体组成。群体中,47%的标记位点之
cM范围内普遍存在。在决定系数r2。0.05时,LD
间可以观察到显著的LD(P≤0.05)。LD在遗传距离小于120
在0.0l单位的平均衰减距离为29.7cM,在f2≥O.05的条件下能观察到的LD最大遗传距离为31.4cM。在
12≥O.1时能观察到LD的最大遗传距离缩小到3.4cM。群体的连锁不平衡状况表明本研究群体可用于重要育
种性状的关联分析。
关键词:陆地棉;数量性状位点;分子标记;连锁不平衡;群体结构
中图分类号:$562.024文献标志码:A
1)06.0500.07
文章编号:1002.7807(201
Structureand of Resourcesin
Population LinkageDisequilibriumAnalysisGermplasm
Cotton
Upland
ZHANG Shul,YIXian—dal,ZHANG
You—chan91,BIE Chen91,LICheng-qi2,QINHong-del‘
of Instituteof
(1.CashCropInstitute,HubeiAcademyAgriculturalSciences,Wuhan430064,Ch/na;2.HenanTechnology,
453003,Ch/na)
Xinxiang,Henan
structureand 204 cottonaccessionswere with79SSR
Abmaet【=PopulationLD(Linkagedisequilibrium)of analyzed
upland
onnine structurebasedonSSRdatare-
(Simplesequencerepeat)markeI苫locatedchomommes.Analysisofpopulationgenetic
vealedthatthis be intothree
coulddivided outofwhichWCIe ofthree
population groups,two composed
47%oftheSSRloci showedLDat levelofP≤O.05.ThemaximumdistanceofLDcouldbeobserved
pairs significant genetic
extendedto120eM.TheLD was at to
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