整合转录组及全基因组重测序方法鉴定影响猪脂肪沉积的关键基因及其变异.docVIP

　　整合转录组及全基因组重测序方法鉴定影响猪脂肪沉积的关键基因及其变异 第一章文献综述 1.1脂肪沉积在猪育种中的重要作用 畜牧业是农业的重要组成部分之一，对我国的经济发展以及人民生活水平的提高起着重要的作用。其中养猪业是畜牧业的一个重要组成部分。在世界肉类的生产中，猪肉的生产起着重要的作用。随着社会的发展，生产力水平和人民对物质生活的追求的提高，世界上的肉类生产总量在稳步的增加。在猪肉、牛肉、羊肉和禽肉这四种消费量最大的肉类产品，其中猪肉的生产量是肉类生产总量中最大的，占到比较稳定的四成左右（38%)。猪肉生产在各个国家的生产能力也各不相同，差距比较大。目前我国是世界上第一养猪大国，生猪存栏量和猪肉产量接近世界总量的一半。从2001年起，我国的猪肉产量就超过了 4000万吨，远远高于其他国家的猪肉产量。改革开放后，我国肉类的生产总量一直保持着稳定的增长速度，其中猪牛羊鸡肉的生产占绝大多数。我国居民一直有对猪肉有着特殊的偏好。但随着人民生活水平的提高，对蛋白质等营养物质的需求也变的多样化起来。猪牛羊禽肉的产量都在稳定的增加，猪肉在各种肉类产量中所占的比例却在逐渐下降，由90%多下降到60%多的水平》虽然猪肉的产量所占比例在下降，但是在肉类产量中仍然占有绝对主导的地位，还是我国生产最多的肉类品种[1]。 1.2脂肪分化、发育研究 1.2.1脂肪组织 脂肪组织主要由脂肪细胞组成，还有内皮细胞、血细胞、成纤维细胞、巨唾细胞、上皮细胞以及脂肪祖细胞[29]?相比于其他细胞，脂肪细胞的体积非常庞大,其的直径从20nm到200nm不等。脂肪细胞的表面被一些易于连接的组织间质所包裹。由于这些间质的存在，脂肪细胞能够非常合适的进行能量储存和释放。脂肪细胞能吸收机体中多余的能量，并以由甘油三脂形成的脂滴的形式存储。为了容纳这些脂滴，脂肪细胞的直径可以增加20倍，体积更是可以增加上千倍。由于脂肪细胞的绝大部分体积(90%)被脂滴所占据，其细胞核和细胞质被推到了细胞的边界上[30]。 1.2.2脂肪细胞的和分化 脂肪组织在体内的分化时间和还不是特别清楚。多潜能干细胞[31]、胚胎干细胞[32]和骨髓衍生的基质细胞[32]都能诱导生成脂肪细胞或前脂肪细胞。可见，胚胎干细胞或多潜能干细胞可能是脂肪细胞的直接。经过多年的探索，人们对脂肪细胞和脂肪组织的起源有了一定的认识。通过研究多种多能干细胞系，人们发现脂肪细胞是由中胚层的多能干细胞逐步分化、发育而成的。脂肪分化现在被认为是一个通向成熟的脂肪细胞的动态和可塑化的过程。中胚层细胞分化成为脂肪细胞一般始于妊娠的中后期。由于现存脂肪细胞的体积迅速增大和前脂肪细胞的迅速增殖，白色脂肪组织迅速的增加[33]。脂肪细胞分化过程一般包括：中胚层起源的多能干细胞定向为脂肪祖细胞，脂肪祖细胞分化为前体脂肪细胞（Pre-adipocyte),前体脂肪细胞最终分化为成熟脂肪细胞（Mature adipocyte) [34]。 第二章试验群体构建及脂肪对肉质的影响 为选择脂肪沉积极端的个体，本研究以活体背膘厚度为指标，利用兽医B型超声波背腰仪，对松辽黑猪和长白猪的群体进行活体背膘的检测。比较用体重的校正公式校正后的活体背膘厚度，找出具有极端背膘厚度个体。为了消除后续试验遗传背景差异所造成的影响，本研究尽量优先选取具有血缘关系的个体。对选取的极端个体进行屠宰，并进行测定和取样。研究猪品种和背膘厚度对肌肉、脂肪组织结构和肉品质的影响。 2.1试验材料 2.1.1试验群体 本研究所用的试验群体来自天津宁河原种猪场，其中松辽黑猪为53头，长白猪132头。相同条件下同批饲养至100公斤左右的母猪进行屠宰。 . 2.1.2主要仪器 数显游标卡尺HS1500兽用B型超声波诊断仪：日本Honda公司 液氮罐：四川乐山机电工贸有限公司 OPTO-STARpH 测定仪：德国 Rudolf Mathaeus 公司 CR-410色彩色差计：日本柯尼卡美能达控股公司 RH-1000电脑压肉试验仪：广州润湖仪器有限公司 C-LM4数显式肌肉嫩度仪：东北农业大学YLE-1000恒温水浴箱：北京时代北利有限公司 FOODSCAN近红外食品成分快速分析仪：丹麦福斯分析仪器有限公司 手动式切片机：德国Leica公司 CM1900冰冻切片机：德国Leica公司 Zeiss AX10 SCOPEA正置显微镜：德国Carol-Zeiss公司 . 2.2试验方法 2.2.1群体的背膘活体测定 测定猪群为宁河猪场内的松辽黑猪和长白猪，活体重在100kg左右。均身体健康，在相同环境下进行饲养。将待测定猪赶入限位栏内，记录猪只的耳标号和体重。在倒数3、4助间据背中线5 cm用HONGDA HS-1500型兽用B超机进行背膘的测定。测量位置剪毛探头平面涂上稱合剂猪背测量位置涂上