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第七章 基因组学与基因预测 20世纪人类科技发展史上的三大创举 90 年代 60 年代人类首次登上月球 40 年代第一颗原子弹爆炸 鸟枪法基因组测序 7.1基因组学 研究与解读生物基因组所蕴藏的生 物全部性状的所有遗传信息的科学 •结构基因组学 •功能基因组学 •比较基因组学 基因组学包括3个不同的亚领域 结构基因组学(structural genomics) 功能基因组学(functional genomics) 比较基因组学(comparative genomics) 基因组学概念 *结构基因组学 •结构基因组学(structural genomics) 是通过 HGP 的实施来完成的。 •HGP 的内容就是制作高分辨率的人类遗传图 和物理图，最终完成人类和其它重要模式生物 全部基因组DNA 序列测定，因此HGP属于结 构基因组学范畴。 *功能基因组学 •完成一个生物体全部基因组测序后即进入 后基因组测序阶段——详尽分析序列，描 述基因组所有基因的功能，包括研究基因 的表达及其调控模式，这就是功能基因组 学（functional genomics）。 主要具体内容包括以下方面 （一）鉴定DNA序列中的基因 （二）同源搜索设计基因功能 （三）实验性设计基因功能 （四）描述基因表达模式 功能基因组学研究策略及主要内容 功能基因组学研究 1. 概念：利用结构基因组学提供的信息 ，以高通量，大规模实验方法及统计与 计算机分析为特征，全面系统地分析全 部基因的功能。 2. 基因功能的研究方法 （1） 基因转导技术：导入细胞，观 察功能。该方法用的最多，技术最 成熟。 比较基因组学(Comparative Genomics) 是基于基因组图谱和测序基础上，对 已知的基因和基因组结构进行比较， 来了解基因的功能、表达机理和物种 进化的学科。 基本完成DNA序列分析的真核生物基因组比较 物种 完成 总长度 已完成总长 占常染色质 基因数 年份 /Mp 的百分数/% 百分数/Mb /Mb 酵母 1996 12 93 100 483 线虫 1998 96 99 100 197 果蝇 2000 116 64 97 117 拟南芥 2000 115 92 100 221 人类第21染色体 2000 34 75 100 7 人类第22染色体 1999 34 70 97 16 人类全基因组 2001 2693 84 90 12 (Public Sequence) 人类全基因组 2001 2654 83 99-93 15 (Celera Sequence) 7.2基因预测  基因预测：早期指预测DNA序列中编码蛋 白质的部分，即外显子部分；现在指整个 基因结构的预测，综合各种外显子预测