青花菜快速碱化因子ral f的克隆与序列分析 - 三博远志.pdfVIP

园　艺 　学 　报 　2006, 33 ( 3) : 561～565 A cta Horticu lturae Sin ica 青花菜快速碱化因子 RAL F 的克隆与序列分析 1, 2 2 2 2 1 2 张国裕 　康俊根 　张延国 　娄 　平 　程智慧 　王晓武 (1 西北农林科技大学园艺学院 , 陕西杨凌 712 100; 2 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 , 北京 100081) 摘 　要 : 以一个与甘蓝显性核不育相关的差异表达片段序列为信息探针 , 在 NCB I与 TA IR 网站数据库中 进行同源 EST序列搜索 , 经人工拼接 、RT - PCR 克隆与序列分析验证 , 获得了青花菜快速碱化因子 RAL F (R ap id A lkalinization Factors) 基因的 cDNA 全长序列 , 命名为 B oRAL FL 1 ( GenB ank 序列登录号 DQ059310) 。 该 cDNA 全长 240 bp , 编码 79个氨基酸 , 与电子克隆获得的序列完全相同。序列分析表明, 编码蛋白存在前 导信号肽与多个磷酸化位点 , 与同源基因 RAL FL 8核酸序列在 88 bp 上有 82%的一致性 , 推导的氨基酸序列在 74个氨基酸上存在 56%的一致性 , 不同植物间氨基酸序列 N - 端差异大 , C - 端具有较高的保守性 。 关键词 : 青花菜 ; 快速碱化因子 (RAL F ) ; 基因克隆; R TPCR 中图分类号 : S 635　　文献标识码 : A 　　文章编号 : 0513353X (2006) 03056 105 C lon ing and Sequence Ana lyz ing of a Gene ( RAL F ) from Broccoli 1, 2 2 2 2 1 2 Zhang Guoyu , Kang Jungen , Zhang Yanguo , Lou P ing , Cheng Zh ihu i , and W ang X iaowu ( 1 Colleg e of H orticu ltu re, N orthw es tA F Un ivers ity, Yang ling, S hananx i 7 12 100, Ch ina; 2 Ins titu te of Veg etables and F low ers, Ch inese A cadem y of A g ricu ltu ra l S ciences, B eij ing 100081, Ch ina) A b stract: A differen tial TD F ( Tran scrip t D erived Fragm en ts) in a cDNA A FL P analysis of bud s from m ale sterile and fertile line s of cabbage wa s u sed a s a querying p robe to b la st the GenB ank ( h ttp : / / www ncb in lm n ihgov /BLA ST) and A rabidop s is ( h ttp : / /www arab idop sisorg /B lA ST) databa se. B a sed on the a ssem b led homo l