骨几何学参数及四肢瘦体重的双变量全基因组关联研究.pdfVIP

分类号 Q三垒!：B5窆鱼：三一 密级 学校代码 4020012 旭05鲤 学号——20081 骨几何学参数和四肢瘦体重的双变量 全基因组关联研究 ■、● ■ ． ■ ■ ■ ■ 一 bI r i VaI ate deassocl atI On genome—w anaI ofbone r rameters yses geomet ypa and i CUI ar I eanma append ss 研究．生姓名 剥、璐 指导教师姓名、职称 学 科 专 业 研 究 方 向 垫匠 湖南师范大学学位评定委员会办公室 二零一一年四月 lIlll l II[I[1lUll lidl Y1913067 中 文摘 要 骨骼和肌肉两者联系紧密，共同构成肌肉骨骼系统的主体。骨 几何学是骨骼的重要参数并与相关疾病如骨质疏松等密切相关，四 肢瘦体重(ALM)则是肌肉的重要参数也与一些疾病如肌肉减少症等 息息相关。研究证明股骨颈骨几何参数(FNGP)如：骨直径(W)、 S 截面面积(CA)、皮质厚度(CT)、曲率(BR)、截面系数(Z) 与瘦体重具有很高的遗传相关性，但目前对同时调控这两种表型的 SNP／基因还知之甚少。全基因组关联分析(GWAS)已被证明是检测 多效基因的有效手段，为了鉴定FNGP与ALM之间共同的调控SNP／ 基因，我们对一大样本量的中国人群进行了双变量GWAS。 本研究共有1627位无血缘关系的中国汉人参与，其中男性802 位，女性825位。我们采用双能X射线骨密度仪测量他们的ALM和 组SNP6．0分型芯片，经基因分型共测定了约90万个SNP，其中的 689368个被选择用于后续的关联研究。本研究采用基于线性模型的 双变量回归分析检测某个SNP同时与两个表型的关联度，关联程度 位于前列的SNP进一步在2286名白人中进行重复验证。 中位于HK2(己糖激酶2)基因上的耶聊剃和UMOD(尿调蛋白) 基因上的rsll859916与两个表型的双变量关联P值分别为： 在白人中进行重复验证的结果也达到了O．05的显著水平，相应的P 值分别为0．024和0．047，荟萃分析合并两次研究的结果得到相应的 生物学功能方面的研究也表明HK2基因和UMOD基因可能是同时影响 锁群也同时与FNGP和ALM相关，这个连锁群在染色体上的跨度约为 130Kb，包含MIR873(MicroRNA873)和MIR876(Micr