衣原体噬菌体phicpar39衣壳蛋白vpl二级结构及 - 第三军医大学学报.docVIP

衣原体噬菌体phiCPAR39衣壳蛋白Vpl二级结构及B细胞抗原表位预测 姚卫锋1，卢桂玲1，谢艳秋1，于旺1，宋蒙蒙1，李士颖1（1. 天津中医药研究院附属医院，天津 300120；2. 天津公安医院，天津 300042） 摘要：目的 分析衣原体噬菌体phiCPAR39 Vpl蛋白的二级结构并预测其B细胞表位。方法 以phiCPAR39 Vpl氨基酸序列为基础，采用Gamier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus-Schulz法分析二级结构；按Kyte-Doolittle法、Hopp-Woods法、Emini法和Jameson-Wolf法预测蛋白的抗原表位。结果 phiCPAR39 Vpl蛋白二级机构复杂，含多个抗原位点，预测其N端l-10, 103-109, 158-166, 190-197, 252-260, 273-285, 310-316,333-341,359-367,414-420,466-476, 511-516为优势表位。结论 phiCPAR39 Vpl蛋白有较强的免疫原性，预测的抗原位点为之后蛋白相互作用研究和衣原体噬菌体野生株筛查奠定了理论基础。 关键词：phiCPAR39蛋白；二级结构；细胞表位；抗原性 Prediction of secondary structure and B-cell epitopes of capsid pro