油桐β-酮脂酰-CoA合成酶（KCS）基因的克隆与序列分析.PDFVIP

第31 卷 第4 期 经 济 林 研 究 Vol. 31 No.4 2013 年12 月 Nonwood Forest Research Dec. 2013 油桐 酮脂酰 CoA合成酶（KCS）基因的 β- - 克隆与序列分析 1,2 1,2 1,2 1,2 周俊琴 ，谭晓风 ，刘美兰 ，龙洪旭 （1. 经济林培育与保护教育部重点实验室，湖南 长沙 4 10004 ；2. 经济林育种与栽培国家林业局重点实验室， 湖南 长沙 4 10004 ） 摘 要： β KCS 为给油桐 - 酮脂酰-CoA 合成酶基因 （ ）结构和功能的研究提供参考，以油桐种子为材料，根据油 桐转录组测序分析结果设计引物，利用RT-PCR 技术克隆KCS 基因，并进行了序列分析。获得了1 条KCS 基因 Vf_KCS KCS 的全长cDNA ，命名为 。 基因的CDS 长度为1 338 bp ，编码446 个氨基酸。该基因编码的蛋白质具 有3 个酶活性位点、6 个产物结合位点、5 个丙二酰-CoA 结合位点和多个二聚体形成位点；Vf_KCS 有2 个明 α β 显的跨膜螺旋拓扑结构和3 个疑似跨膜螺旋拓扑结构；二级结构主要由 - 螺旋、 - 折叠和不规则卷曲构成，该 蛋白为亲水性蛋白。Vf_KCS 编码的氨基酸序列与其它物种的KCS 氨基酸序列具有较高的相似性，其中与葡萄 的KCS 基因相似度最高达89.69%，与其它植物的KCS 基因所编码的氨基酸同源性大多在80% 以上。进化树分 析结果表明，Vf_KCS 与拟南芥亲缘关系最为接近。预测分析结果表明，该酶有高度保守的催化区域。 关键词： β Vf_KCS 油桐； - 酮脂酰-CoA 合成酶； ；生物信息学 中图分类号：S603.2 ；S794.3 文献标志码：A 文章编号：1003—8981(2013)04—0052—06 Cloning and sequence analysis of β-ketoacyl-CoA synthase (KCS) gene in Vernicia fordii ZHOU Jun-qin1,2, TAN Xiao-feng1,2, LIU Mei-lan1,2, LONG Hong-xu1,2 (1. Key Lab of Non-wood Forest Culturing and Protection of the National Ministry of Education, Changsha 4 10004, Hunan, China;2. State Key Laboratory of Non-wood Forest Cultivation and Breeding, Changsha 4 10004, Hunan, C