bligateoildegradingmarinebacteria-生物化学与分子生物学.PPT

Obligate oil-degrading marine bacteria 海洋专性石油降解细菌 海洋专性石油降解细菌 引言 OHCB的生物学分类 OHCB的生物地理学研究 OHCB生理生态学的遗传基础 OHCB在石油降解微生物中的地位 OHCB在生物技术中潜在的应用 总结 引言 自第一类降解烃类化合物的细菌被分离并且被描述以来，已经过了将近一个世纪了，最近期的名单中包括将近200个细菌、蓝藻、藻类和真菌属，代表了500多个品种和品系 。 但是真正的海洋烃类化合物降解微生物只在最近才发现。 OHCB的生物学分类 迄今为止，分离的各种各样的石油降解菌中，仅有不到1/4是来源于海洋的。仅有来自于真细菌的19个属的菌株，通过它们对培养基NaCl的专性要求，被定性为海洋原生生物 。 OHCB一个显著特点即所有上述细菌都表现出“BIOLOG异常”： “BIOLOG异常”：在BIOLOG系统的95种底物中只有两种能够引起生长，即对吐温40和吐温80 ，它们是含有长链烷基的底物。 这种利用烃类化合物的高度底物特异性似乎更多是海洋烃降解细菌的特性而不是土壤细菌; 因此，到目前为止，只有3种具有类似的严格底物特异性的石蜡降解菌才被从陆地环境中分离出来。 OHCB的生物地理学研究 目前的情况（至2006年底）是，在所有类型的海洋环境中，有250多个Alcanivorax属的细菌已被分离出来或由16S rRNA 基因序列检测出来了。 如表层水，浅层和深海水体，沉积物，火山岩浆或火山泥中，泥石流体和灰鲸胴体，在珊瑚，海绵和水产养殖业中的毒涡鞭毛藻中。 Alcanivorax 属细菌在少数几个地面环境中也有被发现，这些环境与海洋生态系统共同具有相关的属性（如盐度，烃类的存在） A.borkumensis的无处不在，推测是因为其具有能够在许多渗漏的石油成分上或在源于生物的烃类化合物上生长的能力，那些源于生物的烃类化合物有直链和支链烷烃、异戊间二烯化合物和长侧链的链烷基化合物。 有趣的是，虽然在居住在寒冷极地地区的微生物群落中已经检索到与Alcanivorax相关的16S rRNA基因序列，但至今这些菌体本身更多的是从温带低纬度地区分离得到的。 另外两种OHCB，T.oleivorans和Cycloclasticus SPP.分布也很广泛的，虽然到目前为止，它们大多是在北半球被发现的（图1），这可能是采样偏差的结果。 与世界性的OHCBs相反，嗜冷OHCB Oleispira antarctica（到目前为止，有55个序列），只限于在高纬度的寒冷水域中才能发现。 OHCB生理生态学的遗传基础 长期以来OHCB的生理生态学没有得到广泛的研究是因为: 尽管OHCB的分离是相当简单，但它们是最近才被发现的且许多实验室在使它们长期处于代谢活跃形式并对它们进行纯培养时都遇到了困难。 但最近的一些研究也揭示了海洋OHCB的几种不同寻常的且有趣的生理特征。 1、C. oligotrophus的细胞质是非常稀的，每个细胞的干重要比Escherichia coli低7-8倍，但是其DNA含量却占干重的14%，相比而言Escherichia coliDNA含量仅占干重的2%。更重要的是，这些小菌的细胞外膜广泛地增加了许多其从营养贫瘠的海洋环境中获取营养和多种多样的微量元素的转运系统。 2、C. oligotrophus细胞与甲苯的亲和力是到目前为止报导的最高水平，这一亲和力水平足够这些菌在含有最低耐受浓度烃类的海水中生长。 3、有关A. borkumensisSK2的遗传分析揭示了当海洋中有限的矿物质营养上调时其遗传决定因素的全面情形，尤其是在石油突然进入后导致严惩的碳/氢比和碳/磷比失衡的情况下，将引起其相应的基因调节。这组具有搜索功能的遗传因子使得A. borkumensis SK2在突然出现烃类时能够有效地被开发它的烃类代谢功能，同时又能适应所发生的碳/氮不平衡状况。这些功能也解释Alcanivorax在此类环境中的竞争优势。 4、A. borkumensis SK2可降解多种化合物，包括长达C32的直链烷烃，长链异戊二烯类似物，植烷，青藤碱组降植烷，芳香族烷烃。虽然以长链异戊二烯类似物作为培养底物时出现了一个明显的缓滞期，但是其两倍的指数型生长曲线却与在十六烷和姥鲛烷中的生长曲线相类似。 两类烃化合物降解操纵子基因组织形式 1、烷烃类降解酶操纵子 在多种细菌中均发现alkSB1GHJ基因蔟（见图2a）。alkS/alkB1的对比序列分析揭示了这些细菌和A. borkumensis的基因组织结构比起土壤假单胞菌属更加相似