基因名MYB90.docx

研究生课程论文 题 目： MYBA3 基因与其相关蛋 白质结构的分析 姓 名： 张培安 学 院： 园艺学院 专 业： 果树学 学 号： 2016104012 指导教师： 王三红 职称： 副教授 2017 年 1 月 20 日 南京农业大学教务处制 MYBA3 基因与其相关蛋白质结构的分析 摘 要：本文选取葡萄花色苷生物合成相关的调节基因进行生物信息学分析。结果表明， 转录因子 MYBA3 基因的 cDNA 全长序列为764 bp，编码 250 个氨基酸。由该基因推导的蛋白质不具有信号肽结构，具有一定的亲水性， 二级结构以 α-螺旋和无规则卷曲为蛋白质最大量的结构元件。并对其代谢途径及相互作用蛋白进行分析，这为阐明该基因在葡萄花色苷生物合成及调控中的作用提供了依据。 关键词: 葡萄; 调节基因; 生物信息学；蛋白质 Abstract: In this paper, the regulatory genes related to anthocyanin biosynthesis in grape were selected for bioinformatics analysis. The results showed that the full - length cDNA of MYBA3 gene was 764 bp, encoding 250 amino acids. The protein deduced from this gene has no signal peptide structure, has some hydrophilicity, and the secondary structure takes α-helix and random coil as the structural element of the protein. And its metabolic pathway and interaction protein were analyzed, which provided the basis for elucidating the role of this gene in the anthocyanin biosynthesis and regulation of grape. Keyword: grape; regulatory genes; bioinformatics; protein 引言 在葡萄中，对MYB基因功能的研究主要集中在通过控制类黄酮糖基转移酶基因的表达调控花青素的生物合成，MYB5a、MYB5b、MYBPA1和MYBPA2都参与了类黄酮的代谢［1-5］，葡萄全基因组108个R2R3MYB基因已公开发表［6］。 转录因子(Transcription factor，TF)也称反式作用因子，在植物生长发育及其对外界环境的反应中起着重要的调控作用［7］。本文拟从葡萄转色期与着色相关的myb基因家族中的MYBA3 基因进行生物信息学分析，旨在为阐明葡萄花色苷的生物合成及调控奠定基础。 材料与方法 本实验所用到的所有生物信息学分析软件及网站见（表1）。 表1 相关生物信息学分析软件及网站 Tab1 Bioinformatics analysis software and website 项目 Item 软件/网站 Software/Website 获取基因 / 引物设计 BIGMAN 8.0 基因 核苷酸组成 /gene/842957 分子量 BIGMAN 8.0 酶切位点 BIGMAN 8.0 蛋白 氨基酸组成 HYPERLINK /protparam/ /protparam/ 等电点 HYPERLINK /protparam/ /protparam/ 相对分子质量 HYPERLINK /protparam/ /protparam/ 亲疏水性 HYPERLINK /protscale/ /protscale/ 消光系数 HYPERLINK /protparam/ /protparam/ 信号肽跨膜区域 http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/ motif /uniprot/Q9ZTC3 三维结构 /interactive 代谢途径 http://www.genome.jp