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环境微生物学试验
《环境微生物学实验》教学大纲
一、基本信息
课程名称 环境微生物学实验 课程编号 ENSE312 英文名称 Environmental Microbiology Experiment 课程类型 本专业推荐选修课 总学时 18 学分 1 实验项目数 6 验证性实验个数 综合性实验个数 2 设计性实验个数 预修课程 基础微生物学 适用对象 环境科学专业 课程简介
(200字左右) 环境微生物学实验是在理论课的基础上设置的,其核心思想是通过环境微生物技术和其他技术方法相结合,在生物与环境和谐、人与环境统一的基础上解决环境问题。
与理论课程相对应,实验课程也分为三部分,第一部分利用传统微生物学手段研究环境微生物,包括环境微生物的分离纯化、培养、鉴定以及数量测定等;第二部分为微生物对环境中污染物以及固体废弃物的生物降解实验,包括有机污染物降解和水解实验等;第三部分利用现代分子生物学手段研究环境微生物,包括环境微生物总DNA的提取以及基于16S rRNA的细菌鉴定等,所涉及的技术包括DNA提取技术、PCR技术以及电泳技术等。
本课程是环境科学专业的一门专业推荐选修课程,是与环境微生物学所对应的实验课程。通过本课程的学习,学生应掌握培养基的制备以及分离纯化和培养计数等技术,掌握从野外微生物群落中获得纯培养菌株的方法和流程,并掌握环境微生物总DNA的提取方法和步骤以及利用PCR技术在属的水平上鉴定环境中细菌类群
序号 实验内容 学时 实验一 筛选培养基的制备以及土壤微生物的分离纯化和培养 3 实验二 土壤中细菌、真菌和放线菌的平板计数 3 实验三 产淀粉水解酶菌株的筛选和活性验证 3 实验四 多环芳烃降解菌的筛选和功能验证 3 实验五 土壤微生物总DNA的提取 3 实验六 细菌16S rRNA基因的PCR扩增和电泳检测 3 合计 18 四、实验内容及教学要求?
实验一: 筛选培养基的制备以及土壤微生物的分离纯化和培养
本实验目的:了解微生物培养基种类及配置原理,微生物培养基的配制程序了解微生物培养基的种类及配置原理,理解微生物培养基的配制程序,掌握牛肉膏蛋白胨培养基、高氏一号培养基、马丁氏培养基、基础盐培养基和CMC-Na培养基的配制方法。
微生物培养基的配制程序牛肉膏蛋白胨培养基、高氏一号培养基马丁氏培养基本实验目的:了解利用培养基筛选产水解酶菌株的原理,掌握从土壤中分离筛选产水解酶菌株的方法。
本实验教学要求:了解利用培养基筛选产水解酶菌株的原理,掌握从土壤中分离筛选产水解酶菌株的方法。
本实验重点、难点:重点是利用培养基从土壤中分离筛选产水解酶菌株;难点是利用培养基验证产水解酶菌株活性的原理。
培养基培养基培养基实验五: 土壤微生物总DNA的提取
本实验目的:熟悉从土壤中提取微生物总DNA的原理,掌握从土壤中提取微生物总DNA的方法。
本实验教学要求:了解从土壤中提取微生物总DNA的原理和各种土壤总DNA提取方法,理解土壤微生物总DNA提取过程中各种试剂的作用,掌握从土壤中提取微生物总DNA的原理的方法。
本实验重点、难点:重点是利用直接法从土壤中提取微生物总DNA的方法;难点是土壤微生物总DNA提取过程中所使用的各种试剂的作用以及影响DNA提取效率的因素。
实验六: 细菌16S rNA基因的PCR扩增和电泳检测
本实验目的:了解以通用引物进行16S rNA基因 PCR扩增的基本原理,掌握从土壤微生物总DNA中进行16S rNA基因PCR扩增的方法。
本实验教学要求:了解以通用引物进行16S rNA基因PCR扩增的基本原理,理解以细菌通用引物扩增细菌16S rNA基因的目的,掌握从土壤微生物总DNA中进行16S rNA基因PCR扩增的方法。
本实验重点、难点:重点是利用PCR技术从土壤微生物总DNA中进行16S rNA基因扩增并进行电泳检测;难点是PCR扩增技术和电泳技术的基本原理以及影响PCR扩增的因素。
课程考核分课堂表现和实验报告两部分,前者占总成绩30%后者占总成绩70%,总成绩由两部分加合生成
教? 材:《环境微生物学实验指导》,郑平主编,浙江大学出版社,2005年,标准书号:ISBN 7-308-04184-0。
参考书:《环境微生物实验技术》,陈坚、刘和、李秀芬、华兆哲编著,化学工业出版社,2008年,标准书号:ISBN 978-7-122-02615-6。
《环境工程微生物学实验》,苑宝玲、李云琴编著,化学工业出版社,2005年,标准书号:ISBN 7-5025-7771-8。
大纲修订人: 刘 娟
大纲审定人:
修订日期:2015年4月30日
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