基于分子对接虚拟筛选mEK1中药抑制活性成分 - 中国中药杂志.PDF

２０１７年５月 第４２卷第１０期 Ｖｏｌ４２，Ｎｏ１０ Ｍａｙ，２０１７ 基于分子对接虚拟筛选 ＭＥＫ１中药抑制活性成分 １，２ １，２ １，２ 黎永良 ，杜志云 ，郑杰 （１广东工业大学轻工化工学院，广东广州５１００００； ２广东工业大学天然药物与绿色化学研究所，广东广州５１００００） ［摘要］　有丝分裂原活化蛋白激酶激酶１（ｍｉｔｏｇｅｎａｃｔｉｖａｔｅｄｐｒｏｔｅｉｎｋｉｎａｓｅｋｉｎａｓｅ，ＭＥＫ１）的过度磷酸化是黑色素瘤成因之一， 基于该靶点的中药成分虚拟筛选有望发现中药在治疗黑色素瘤潜在应用价值。采用 ＭＥＫ１晶体构象构建口袋模型和Ｆｌｅｘ Ｓｅａｒｃｈ模型，模型可很好重现晶体结构，对接配体构象与晶体结构中原配体构象 ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ评分为０７８４；对接评分与已有 ２ ＭＥＫ１抑制剂活性数据ｐＩＣ呈线性关系，Ｒ ＝０９３７，进一步表明虚拟筛选模型可靠。以口袋模型对Ｌｉｐｉｎｓｋｉ五规则初筛的中 ５０ 药成分库进行分子对接，根据ＦｌｅｘＳｅａｒｃｈ模型精筛，最终得到５０个总分高于７０的化合物，该研究给出总分高于阳性对照的 前１０个中药成分，有望进一步用于ＭＥＫ１和黑色素瘤抑制的研究。 ［关键词］　ＭＥＫ１抑制剂；中药成分；分子对接；虚拟筛选 ＤｏｃｋｉｎｇｂａｓｅｄｖｉｒｔｕａｌｓｃｒｅｅｎｉｎｇｏｆＭＥＫ１ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓｆｒｏｍＣｈｉｎｅｓｅｈｅｒｂｓ １，２ １，２ １，２ ＬＩＹｏｎｇｌｉａｎｇ ，ＤＵＺｈｉｙｕｎ ，ＺＨＥＮＧＪｉｅ （１ＳｃｈｏｏｌｏｆＣｈｅｍｉｃａｌＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇａｎｄＬｉｇｈｔＩｎｄｕｓｔｒｙ，ＧｕａｎｇｄｏｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ５１００００，Ｃｈｉｎａ； ２ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＮａｔｕｒａｌＭｅｄｉｃｉｎｅａｎｄＧｒｅｅｎＣｈｅｍｉｓｔｒｙ，ＧｕａｎｇｄｏｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ５１００００，Ｃｈｉｎａ） ［Ａｂｓｔｒａｃｔ］　ＴｈｅｈｙｐｅｒｐｈｏｓｐｈｏｒｙｌａｔｉｏｎｏｆＭＥＫ１（ｍｉｔｏｇｅｎａｃｔｉｖａｔｅｄｐｒｏｔｅｉｎｋｉｎａｓｅｋｉｎａｓｅ１）ｉｓｏｎｅｏｆｔｈｅｃａｕｓｅｓｆｏｒｍｅｌａｎｏｍａＩｔｉｓ ｉｍｐｏｒｔａｎｔｔｏｄｉｓｃｏｖｅｒａｐｏｔｅｎｔｉａｌｍｅｄｉｃｉｎｅｆｏｒｍｅｌａｎｏｍａｔｈｒｏｕｇｈｖｉｒｔｕａｌｓｃｒｅｅｎｉｎｇｏｆｃｈｅｍｉｃａｌｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｏｆＣｈｉｎｅｓｅｍａｔｅｒｉａｌｍｅｄｉｃａｏｎ ＭＥＫ１Ｉｎｔｈｉｓｓｔｕｄｙ，ａｄｏｃｋｉｎｇｐｏｃｋｅｔｍｏｄｅｌａｎｄＦｌｅｘＳｅａｒｃｈｍｏｄｅｌｗｅｒｅｂｕｉｌｔｂｙｕｓｉｎｇａＭＥＫ１ｃｒｙｓｔａｌｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，ｔｈｅｓｉｍｉｌａｒｉｔｙｂｅ ｔｗｅｅｎｃｏｎｎｅｃｔｏｒｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎａｎｄｇａｍｅｔｏｐｈｙｔｅｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｉｎｔｈｅｃｒｙｓｔａｌｓｔｒｕｃｔｕｒｅｗａｓ０７８４Ｔｈｅｒｅｗａｓａｌｉｎｅａｒｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｂｅｔｗｅｅｎ ２ ｔｏｔａｌｓｃｏｒｅａｎｄｐＩＣｏｎＭＥＫ１ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ，ｗｉｔｈＲ ＝０９３７，ｗｈｉｃｈｆｕｒｔｈｅｒｉｎｄｉｃａｔｅｄｔｈｅｒｅｌｉａｂｉｌｉｔｙｏｆｔｈｅｖｉｒｔｕａｌｓｃｒｅｅｎｉｎｇｍｏｄｅｌＴｈｅ ５０ ｓｅａｒｃｈｌｉ