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·414 · 南方医科大学学报(J South Med Univ ) 2011;31(3) ·基础研究· 来自不同地区的两组鼻咽癌活检组织样本共同失调的基因功能 及通路 熊艺颖,黄仲曦 南方医科大学肿瘤研究所,广东 广州 510515 摘要:目的 探究两组鼻咽癌活检组织样本中差异基因表达谱所显示的失调基因功能及通路的相同之处。方法 利用生 物信息学的方法分析两组差异表达基因谱,对比其失调的基因功能及通路,同时探索其相同的失调功能与两组数据间相 同的基因的关系。结果 两样本中显著上调的基因主要与细胞的周期调控、增殖、DNA 损伤修复、细胞的粘附迁移、代谢 及蛋白质结合等相关,但是显著下调的基因无明显的功能聚类;两差异基因表达谱显示出的相同失调基因功能并不是完 全由它们的相同基因引起;两者共同失调的通路有10条,排在前4 位的为白细胞内皮迁移、细胞粘附分子、粘着斑和磷脂 酰肌醇信号系统。结论 来自两个不同地区的鼻咽癌活检组织样本的比较发现,其差异表达的基因多与细胞周期调控、 DNA 损伤修复、粘附迁移等相关,这与临床治疗首选放疗的原因相符;通路分析得出4 条差异最显著的共同通路也与肿瘤 粘附迁移相关,通过干扰其在肿瘤中的病理作用,特别是磷脂酰肌醇信号系统在肿瘤发生、粘附及转移等关键步骤中的信 号传导作用,有望提高鼻咽癌的治疗效果及预后。 关键词:鼻咽癌;生物信息学;基因功能;通路 中图分类号:R739.63 文献标志码:A 文章编号:1673-4254(2011)03-0414-05 Common dysregulated genes and pathways in two sets of nasopharyngeal carcinoma biopsy samples from differential regions XIONG Yi-ying, HUANG Zhong-xi Cancer Institute, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China Abstract: Objective To explore the common dysregulated genes and pathways shared by two sets of nasopharyngeal carcinoma (NPC) biopsy samples collected from different regions. Methods Using bioinformatics analysis, the dysregulated genes and pathways in the two sets of samples were compared, and the relationship between the common dysregulated functions and genes was explored. Results The common up-regulated genes in the two sets of samples were involved with such cell functions as cell cycle regulation, cell proliferation, DNA damage and repair, cell adhesion and migration, cell metabolism, and protein binding, but their common down-regulated genes did not show functional clu

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