以次世代定序技术为癌症病患筛选抗癌药物及诊断标的.ppt

化學治療機制示意圖 化療以阻止中央核心區（Central Dogma）從DNA →RNA→蛋白質合成的過程。 From 台大校友雙月刊 鄭安理 癌細胞分裂，需先有DNA複製，訊息再傳到 RNA及Protein，即所謂的Central Dogma。化療的機制主要為阻止或破壞此一過程。譬如antimetabolites阻止purines/pyrimidines的合 成，alkylating agents造成DNA的斷裂等。另一方面，人體仍有許多的正常細胞需要不斷分裂增殖，包括造血細胞，黏膜細胞，毛髮，和生殖細胞等，卻因化學治療不可避 免地連帶受到損傷，而出現絕大多數化療共通的副作用：白血球及血小板低下，口腔潰爛，掉髮，及生殖功能受損等。20世紀下半葉，化療成了癌症病人共同的夢 魘。 近代癌症化學治療的先驅，來自40年後的戰場。1943年12月2日，德軍轟炸盟軍Bari港（義大利，俗稱第二珍珠港）。被炸沈的John Harvey艦，溢出大量芥子氣，導致許多人死亡。由於芥子氣屬化學戰劑，為日內瓦公約所禁止，故盟軍封鎖該則消息。所幸，隨行軍醫在病理解剖中發現，死亡的人出現嚴重骨髓造血抑制及淋巴萎縮的現象。此一發現密傳回耶魯大學後，研究者推測該化學物質可能對於分裂中的細胞有毒性。而癌細胞的特徵之一便是不斷分裂增殖。經過持續改良，第一個癌症治療藥物nitrogen mustard，一種alkylating agent，終於問世。（Goodman LS et al. JAMA 1946;132:126-32） 之後的50年，癌症藥物的主流便是化學治療。然而化學治療藥物的攻擊對象為分裂增殖的細胞，不論是癌細胞還是正常細胞。如圖1所示。 芥子氣是一類皮膚糜爛性毒劑，可通過皮膚、眼、呼吸道及胃腸道等途徑使人中毒，導致皮膚及黏膜組織細胞發炎、糜爛、壞死等病理變化，利比亞芥子氣吸收，引起多臟器中毒症狀。 其化學結構式為S(CH2CH2CL)2，工業芥子氣呈黑褐色，精餾芥子氣無色或呈微黃色。芥子氣為油狀液體，揮發度小，有類似大蒜的氣味，但低濃度或嗅覺適應後，氣味不明顯。芥子氣微溶於水，易溶於有機溶劑和脂肪，易穿透皮膚、黏膜，對布料、木材、皮革、橡膠、塑料等物品穿透作用較強。 標靶治療的出現 分子生物學的快速發展，在20世紀的後30年，讓我們對癌症致病機轉有更深入的理解。隨著各種致癌基因（oncogenes）的發現，癌症治療出現了新的可 能性。慢性骨髓性白血病（CML）即是最好的典範。CML的細胞有專一性的突變，過去被稱為「費城染色體」，即第9及第22染色體之間的轉位，造成了一個 正常細胞所沒有的新蛋白質（Bcr-Abl）。Bcr-Abl本身是一個已活化的激酶，不斷刺激CML細胞的生長。針對Bcr-Abl尋找抑制其功能的化 學物質，在1980年代即展開。終於，一個嶄新的藥物imatinib在20世紀末誕生了。Imabtinib與其他化療藥物不同，其所抑制的主要標的 Bcr-Abl，只存在癌細胞中，所以對正常細胞的影響很小。 標靶治療對正常細胞的傷害遠低於化學治療；一般的化療，難免傷及其他正常的分裂細胞，而標靶治療作用在癌細胞特有的標的上，突顯其癌細胞專一性。Imatinib在臨床應用上甚為成功，它 CML的治癒率提升了將近50%，且副作用遠少於化學治療。Imatinib在2000年獲FDA核准，標示了癌症治療新世紀的來臨。21世紀 前10年，抗癌藥物的發展即以標靶治療為主 以次世代定序技術為癌症病患篩選抗癌藥物及診斷標的 癌症的發生主要是細胞基因發生變異，常見的是在染色體內或染色體間發生相互重組的現象，而導致染色體結構的不穩定。根據研究指出，即使是同一種癌症，在不同病患內的癌細胞顯現出的基因變異模式皆不相同。因此，為了防止病患接受不適當的抗癌藥物治療，導致化療後不但沒有成 效，更受到副作用的侵害，癌症的治療需分析每個病患基因變異的模式，針對每個病患特有的變異做最精確的抗癌藥物篩選，除此之外，找出的變異區也可做為後續 診斷的依據。 以往在臨床上現有分析癌細胞基因變異特性的方法，僅侷限於與生長週期有關的重要基因部分片段。 直到近年來，次世代定序技術的成熟，配合mate pair sequencing的技術，能在短時間內及較低成本的狀況下，瞭解病患癌細胞基因體的重組狀況。Rebecca J. Leary研究團隊在2010年提出的personalized analysis of rearranged ends (PARE)2，即完整表達上述的治療策略 雖然次世代定序技術目前大部分仍然侷限於應用在學術研究，但在定序技術快速成長而定序成本越來越低的趨勢下，相信在下個十年內，對於臨床醫療的診斷及治療，次世代定序技術能有著相當關鍵的幫助。 標靶治療藥物讓癌症病患有