沈阳药科大学生物化学课件3 蛋白质.ppt

第三章蛋白质的化学 第一节 蛋白质是生命的物质基础 一、蛋白质是构成生物体的基本成份 二、蛋白质具有多样性的生物学功能 一、蛋白质是构成生物体的基本成份 二、蛋白质具有多样性的生物学功能 1、生物催化作用 2、代谢调节作用 3、免疫保护作用 4、转运和贮存的作用 5、运动与支持作用 6、控制生长和分化作用 7、接受和传递信息的作用 8、生物膜的功能 表3-2 蛋白质生物学功能的重要性 第二节 蛋白质的化学组成一、蛋白质的元素组成 C、H、O、N 一切蛋白质都含有氮元素，蛋白质含氮量一般为15－17％，平均为16％， 蛋白质含量X16％＝蛋白质含氮量 少量S、P、Fe、Mn、I和Zn等 二、蛋白质结构的基本单位－氨基酸（一）氨基酸的结构 ＊20种基本氨基酸的结构通式： 表3-3 氨基酸的结构与分类 表3-3 氨基酸的结构与分类(续) （二） 氨基酸的分类 1.非极性R基氨基酸 脂肪族氨基酸五种(丙、缬、亮、异亮和蛋); 芳香族氨基酸一种(苯丙); 杂环氨基酸两种(脯和色)。 2.极性不带电荷R基氨基酸 含羟基氨基酸三种(丝、苏和酪); 酰氨类氨基酸两种(天胺和谷胺); 含巯基半胱氨酸 甘氨酸。 3.带负电荷的R基氨基酸 谷、天。 4.带正电荷的R基氨基酸 赖、精和组 第三节 蛋白质的分子结构 一级结构：基础，决定蛋白质的空间结构 二级结构 三级结构 空间结构 四级结构 一、蛋白质的一级结构 （一）肽键和肽链 ＊蛋白质是由氨基酸构成，氨基酸之间通过肽键相连。 ＊肽键（peptide bond)：是蛋白质分子中基本的化学键，它是由是由一分子氨基酸的羧基和另一分子氨基酸的氨基脱水缩合而成的，也称酰胺键。 几个名词 ＊肽：氨基酸通过肽键相连的化合物 ＊二肽：由两个氨基酸组成的肽称为二肽。 ＊三肽：三个氨基酸组成的肽，称为三肽。 ＊寡肽：一般把十个氨基酸以下的肽，称为寡肽。 ＊多肽（或多肽链）：十个氨基酸以上的肽，称为多肽或多肽链。 几个名词（续） ＊氨基酸残基：多肽链中的氨基酸，由于参与肽键的形成，不是原来完整的分子，称为氨基酸残基。 ＊共价主链：多肽链中的骨架是由氨基酸的羧基与氨基形成的肽键部分规则地重复排列而成，称为共价主链。 ＊侧链：R基部分，称为侧链。 多肽链的方向性 ＊一条多肽链有两个末端，含有自由α 氨基一端称为氨基末端或N末端；含有α 羧基一端称为羧基末端或C末端。 ＊多肽链书写时将N端写在左边，C端写在右边。 ＊肽的命名也是从N端到C端。 蛋白质一级结构的概念 ＊蛋白质是由不同的氨基酸种类、数量和排列顺序，通过肽键而构成的高分子有机含氮化合物。 ＊蛋白质一级结构中除了肽键之外，有些还含有少量的二硫键。 ＊二硫键是由两分子半胱氨酸残基的巯基脱氢而生成的。 ＊二硫键可以存在与肽链内，也可以存在于肽链间。 ＊多肽链的一级结构存在三种形式，即无分支的的开链多肽、分枝多肽和环状多肽。 二、蛋白质的构象(一）维持蛋白质构象的化学键 1、氢键 2、疏水键 3、盐键 4、配位键 5、二硫键 6、范德华引力 (二）蛋白质的二级结构 α螺旋 ? 折叠 ? 折角 无规则线团 1、肽单位 肽键与相邻的两个α碳原子所组成的基团，称为肽单位或肽平面。 （1）肽键具有部分双键性质，不能自由旋转。 （2）肽单位是刚性平面 （3）肽单位中与C－N相连的氢和氧原子与两个碳原子呈反向分布 肽单位的平面结构 2、α螺旋 （1）右手螺旋，每3.6个氨基酸旋转一周，螺距为0.54nm，每个氨基酸残基的高度为0.15nm，肽键平面与长轴平行。 （2）氢键是α螺旋稳定的主要次级键。 （3）肽链中氨基酸残基的R基侧链分布在螺旋的外侧，其形状、大小及电荷均影响螺旋的形成和稳定性。 α螺旋空间填充模型 抹香鲸肌红蛋白中的一个片段 绿色：C原子 蓝色：N原子 红色：O原子 白色：H原子 黄色：侧链 3、? 折叠 ＊β折叠又称β片层结构，多肽链的肽平面之间呈手风琴状折叠。 ＊此结构具有下列特征： (l) 肽键平面之间一般折叠成锯齿状。 (2) 氢键是维持这种结构的主要次级键。 (3)肽链平行的走向有顺式和反式两种 (4)肽链中氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下 4、? 折角 ＊伸展的肽链形成1800的回折，即U型转折结构。 ＊它是由四个连续氨基酸残基构成。 ＊第一个氨基酸残基的羧基与第四个氨基酸残基的亚氨基之间形成氢键以维持其构象。 5、无规则线团 蛋白质二级结构中除上述有规则的构象外，尚存在因肽键平面不规则排列的无规律构象，称为自由折叠或无规线团。 表3-5 部分蛋白质中α螺旋量 （三）超二级结构 超二级结构(super-secondary structure)是指在多肽内顺序上相邻的二级结构常常在空间